More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0583 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  79.52 
 
 		 424 aa  678    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 425 aa  863    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  70.8 
 
 		 418 aa  610  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  67.93 
 
 		 435 aa  584  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  66.9 
 
 		 434 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  66.27 
 
 		 423 aa  579  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  64.45 
 
 		 434 aa  553  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  66.18 
 
 		 445 aa  550  1e-155  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  65.38 
 
 		 440 aa  541  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  63.72 
 
 		 423 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  63.31 
 
 		 423 aa  511  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  59.72 
 
 		 430 aa  506  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  60.37 
 
 		 457 aa  500  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  58.59 
 
 		 431 aa  491  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  58.04 
 
 		 426 aa  482  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  59.04 
 
 		 430 aa  476  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  56.19 
 
 		 443 aa  464  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  54.95 
 
 		 431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  54.01 
 
 		 431 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  56.7 
 
 		 424 aa  444  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  53.21 
 
 		 443 aa  422  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  53.62 
 
 		 419 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  51.3 
 
 		 444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17730  geranylgeranyl reductase family protein  42.73 
 
 		 466 aa  313  2.9999999999999996e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  36.45 
 
 		 436 aa  220  5e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  33.9 
 
 		 393 aa  201  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  33.5 
 
 		 393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10571  oxidoreductase  33.61 
 
 		 408 aa  182  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649109  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  31.85 
 
 		 393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  31.85 
 
 		 393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  35.4 
 
 		 406 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  35.4 
 
 		 406 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5254  geranylgeranyl reductase  34.16 
 
 		 416 aa  172  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  31.59 
 
 		 393 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  33.42 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1099  geranylgeranyl reductase  35.44 
 
 		 435 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.997696  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0991  geranylgeranyl reductase  32.19 
 
 		 418 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  33.49 
 
 		 415 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  35.61 
 
 		 413 aa  163  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0948  geranylgeranyl reductase  34.41 
 
 		 417 aa  162  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  31.82 
 
 		 411 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  33.96 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  31.97 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  32.1 
 
 		 384 aa  141  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  30.11 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  33.65 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  33.78 
 
 		 425 aa  127  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  32.11 
 
 		 409 aa  126  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  32.75 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  31.15 
 
 		 403 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  27.36 
 
 		 398 aa  117  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  29.95 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0164  putative electron transfer oxidoreductase  31.61 
 
 		 420 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  29.39 
 
 		 415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  25.44 
 
 		 382 aa  112  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  26.5 
 
 		 389 aa  111  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  30.82 
 
 		 379 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  28.86 
 
 		 408 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  32.63 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  28.4 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  33.23 
 
 		 429 aa  106  7e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  27.93 
 
 		 375 aa  106  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  30.33 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  27.56 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  28.9 
 
 		 384 aa  104  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  27.66 
 
 		 396 aa  103  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  26 
 
 		 387 aa  103  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  26.61 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  31.52 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  28.66 
 
 		 406 aa  101  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  22.25 
 
 		 375 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  25.71 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  27.3 
 
 		 385 aa  98.2  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  31.58 
 
 		 384 aa  97.4  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  29.64 
 
 		 362 aa  96.7  7e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  26.59 
 
 		 390 aa  96.7  8e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  31.38 
 
 		 394 aa  96.3  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  31.38 
 
 		 394 aa  96.3  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  27.34 
 
 		 367 aa  96.3  9e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  27.9 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  25.51 
 
 		 390 aa  95.9  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  27.86 
 
 		 407 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 452 aa  95.5  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  29.02 
 
 		 413 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  29.71 
 
 		 403 aa  94.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  28.23 
 
 		 455 aa  94.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0808  geranylgeranyl reductase  32.53 
 
 		 406 aa  94.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  hitchhiker  0.000310699 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  24.51 
 
 		 455 aa  94.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  24.86 
 
 		 395 aa  94.4  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  26.91 
 
 		 368 aa  94.4  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  27.79 
 
 		 379 aa  94  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  26.3 
 
 		 390 aa  93.6  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  27.07 
 
 		 370 aa  93.2  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  25.76 
 
 		 444 aa  92.8  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  24.48 
 
 		 439 aa  92  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  24.48 
 
 		 439 aa  92  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  25.57 
 
 		 380 aa  91.3  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  28.14 
 
 		 391 aa  91.3  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  26.27 
 
 		 379 aa  90.9  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0862  geranylgeranyl reductase  32.52 
 
 		 387 aa  90.1  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>