More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1375 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  82.31 
 
 
390 aa  654    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  79.49 
 
 
390 aa  636    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  100 
 
 
390 aa  788    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  80.51 
 
 
390 aa  665    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  67.77 
 
 
391 aa  558  1e-158  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  40 
 
 
408 aa  270  4e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  39.7 
 
 
406 aa  270  4e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  37.24 
 
 
391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  36.75 
 
 
395 aa  236  5.0000000000000005e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  40.21 
 
 
407 aa  235  9e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  34.44 
 
 
399 aa  218  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  37.5 
 
 
398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  37.47 
 
 
397 aa  211  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  36.41 
 
 
396 aa  208  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  35.57 
 
 
399 aa  206  6e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  35.88 
 
 
402 aa  203  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  36.11 
 
 
398 aa  193  4e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  32.83 
 
 
387 aa  184  3e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  31.83 
 
 
386 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  32.8 
 
 
392 aa  177  3e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  32.15 
 
 
385 aa  176  7e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 
392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  32.18 
 
 
391 aa  170  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 
386 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  33.95 
 
 
416 aa  166  9e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  30.69 
 
 
396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  31.75 
 
 
396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  31.75 
 
 
365 aa  163  6e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  33.87 
 
 
402 aa  159  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 
385 aa  140  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  28.46 
 
 
385 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  31.06 
 
 
341 aa  136  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  31.32 
 
 
381 aa  134  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  27.75 
 
 
375 aa  130  3e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  27.87 
 
 
378 aa  123  5e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  29.36 
 
 
360 aa  123  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  28.7 
 
 
363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  29.2 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  26.1 
 
 
382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  26.01 
 
 
384 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  28.33 
 
 
418 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  29.18 
 
 
453 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  29.31 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  25.14 
 
 
375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  28.86 
 
 
421 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  29.22 
 
 
379 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 
457 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  29.08 
 
 
394 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  29.08 
 
 
394 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  28.1 
 
 
423 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  28.17 
 
 
418 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 
348 aa  103  7e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0513  FAD dependent oxidoreductase  23.62 
 
 
385 aa  103  8e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.349245  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  25.25 
 
 
388 aa  102  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  26.76 
 
 
389 aa  102  9e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  28.83 
 
 
379 aa  102  9e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  26.61 
 
 
425 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  29.97 
 
 
394 aa  101  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  28.64 
 
 
406 aa  100  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  27.07 
 
 
384 aa  100  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  27.45 
 
 
423 aa  99.8  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 
385 aa  99.8  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  28.45 
 
 
424 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  25.45 
 
 
370 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  27.83 
 
 
458 aa  98.2  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  27.86 
 
 
423 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  25.2 
 
 
393 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  27.23 
 
 
385 aa  98.2  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  30 
 
 
380 aa  97.8  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  27.82 
 
 
452 aa  97.4  4e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  26.37 
 
 
455 aa  97.1  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  27.85 
 
 
453 aa  97.4  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  26.54 
 
 
379 aa  97.1  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  26.36 
 
 
457 aa  96.3  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  26.18 
 
 
393 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  27.12 
 
 
405 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  29.18 
 
 
402 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  29.13 
 
 
380 aa  95.5  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2172  geranylgeranyl reductase  27.55 
 
 
353 aa  95.1  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.328813  decreased coverage  0.000000000712182 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2544  geranylgeranyl reductase family protein  27.55 
 
 
353 aa  95.1  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  29.06 
 
 
394 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  25.54 
 
 
398 aa  94.4  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  27.08 
 
 
400 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  27.78 
 
 
406 aa  94.4  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  26.05 
 
 
376 aa  93.6  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  26.61 
 
 
380 aa  93.2  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  28.09 
 
 
426 aa  93.2  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  27.99 
 
 
431 aa  92.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 
393 aa  92.8  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.32 
 
 
446 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  27.03 
 
 
405 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  26.39 
 
 
435 aa  92  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  27.03 
 
 
405 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  26.61 
 
 
452 aa  92  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  26.24 
 
 
434 aa  92  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  25.59 
 
 
398 aa  92  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  25.71 
 
 
382 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.32 
 
 
446 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  26.5 
 
 
445 aa  90.9  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  26.81 
 
 
380 aa  90.9  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>