More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3422 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 407 aa  825    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  71 
 
 		 406 aa  587  1e-166  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  60.85 
 
 		 408 aa  514  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  57.78 
 
 		 391 aa  438  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  52.15 
 
 		 399 aa  396  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  50 
 
 		 402 aa  367  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  48.99 
 
 		 397 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  48.61 
 
 		 398 aa  343  2e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  48.83 
 
 		 398 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  44.05 
 
 		 395 aa  292  6e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  41.15 
 
 		 390 aa  259  4e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  42.05 
 
 		 390 aa  256  4e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  42.25 
 
 		 390 aa  252  7e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  39.25 
 
 		 391 aa  250  4e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  40.21 
 
 		 390 aa  246  6e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  34.17 
 
 		 396 aa  190  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  34.78 
 
 		 387 aa  189  9e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  32.61 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  37.82 
 
 		 365 aa  160  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  33.07 
 
 		 416 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  31.57 
 
 		 396 aa  155  9e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  31.81 
 
 		 402 aa  150  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  28.22 
 
 		 386 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  34.48 
 
 		 381 aa  143  5e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  30.68 
 
 		 375 aa  142  8e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  35.24 
 
 		 341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  29.14 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  28.11 
 
 		 392 aa  134  3e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  30.18 
 
 		 382 aa  134  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  27.03 
 
 		 392 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  25.27 
 
 		 386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  26.53 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 385 aa  127  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  29.92 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  26.49 
 
 		 385 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  25.14 
 
 		 396 aa  123  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  26.84 
 
 		 384 aa  124  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  27.61 
 
 		 453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  27.17 
 
 		 452 aa  116  7.999999999999999e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  32.5 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  32.42 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  29.22 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 		 409 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  28.19 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  30.57 
 
 		 348 aa  110  5e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  29.29 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  29.56 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 414 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  30.93 
 
 		 424 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  29.34 
 
 		 459 aa  107  5e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  27.88 
 
 		 453 aa  106  9e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  27.86 
 
 		 425 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  29.81 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  26.67 
 
 		 378 aa  105  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  30.59 
 
 		 435 aa  103  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  27.29 
 
 		 398 aa  102  9e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  30.91 
 
 		 426 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  28.07 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  30.62 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  30.59 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  27.35 
 
 		 458 aa  99.8  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  27.79 
 
 		 362 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  29.94 
 
 		 382 aa  99.4  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  31.52 
 
 		 411 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  26.49 
 
 		 413 aa  96.7  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 		 413 aa  96.7  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  25.08 
 
 		 370 aa  96.7  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  29.25 
 
 		 445 aa  96.3  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  28.87 
 
 		 430 aa  95.9  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  27.58 
 
 		 423 aa  95.5  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  30.42 
 
 		 360 aa  95.9  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  27.81 
 
 		 423 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  29.2 
 
 		 434 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  25.5 
 
 		 379 aa  94.4  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0783  monooxygenase, FAD-binding  26.84 
 
 		 375 aa  94.4  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0840  monooxygenase FAD-binding  29 
 
 		 401 aa  94  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.634419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 		 376 aa  93.2  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0811  geranylgeranyl reductase  25.57 
 
 		 453 aa  93.2  8e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 		 411 aa  92.4  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  28.65 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  26.85 
 
 		 385 aa  92.8  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  27.83 
 
 		 434 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0881  geranylgeranyl reductase  27.76 
 
 		 455 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170951  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  27.33 
 
 		 421 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  24.23 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0166  geranylgeranyl reductase  25.95 
 
 		 453 aa  90.9  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  25.89 
 
 		 405 aa  90.9  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  26.18 
 
 		 393 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  28.66 
 
 		 375 aa  89  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  23.94 
 
 		 393 aa  89  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  27.66 
 
 		 368 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  25.9 
 
 		 394 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  26.24 
 
 		 431 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  30.2 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  27.84 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  25.9 
 
 		 394 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0114  FAD dependent oxidoreductase  27.67 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00154267  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  30.88 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>