More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0811 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  85.59 
 
 		 453 aa  810    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0811  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 453 aa  919    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  81.46 
 
 		 453 aa  774    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  85.11 
 
 		 452 aa  806    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  51.41 
 
 		 459 aa  425  1e-118  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  38 
 
 		 453 aa  316  5e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0166  geranylgeranyl reductase  34.89 
 
 		 453 aa  289  6e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  31.99 
 
 		 458 aa  186  6e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1514  geranylgeranyl reductase  27.41 
 
 		 485 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00785047 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1377  geranylgeranyl reductase  32.57 
 
 		 467 aa  169  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1413  geranylgeranyl reductase  31.98 
 
 		 456 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.145276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3127  geranylgeranyl reductase  31.16 
 
 		 458 aa  162  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.541663  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0881  geranylgeranyl reductase  32.73 
 
 		 455 aa  161  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170951  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2954  geranylgeranyl reductase  31.4 
 
 		 457 aa  152  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1523  geranylgeranyl reductase  28.23 
 
 		 495 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545892  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2778  geranylgeranyl reductase  30.07 
 
 		 471 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  29.79 
 
 		 406 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  29.49 
 
 		 408 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  34.58 
 
 		 398 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  31.7 
 
 		 398 aa  130  6e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  30.18 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  26.55 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  27.12 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  30.21 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  29.12 
 
 		 402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  32.65 
 
 		 397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 		 414 aa  114  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 410 aa  113  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  28.08 
 
 		 390 aa  106  8e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  27.93 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  27.95 
 
 		 405 aa  102  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  27.75 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 		 413 aa  101  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 		 410 aa  101  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  27.01 
 
 		 407 aa  99.8  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 		 376 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  28.41 
 
 		 365 aa  99.4  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  29.53 
 
 		 457 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  27.68 
 
 		 390 aa  96.3  9e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  30.11 
 
 		 418 aa  94.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  30.45 
 
 		 434 aa  94  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  29.14 
 
 		 425 aa  93.2  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  29.4 
 
 		 423 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  25.18 
 
 		 391 aa  92  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  25.27 
 
 		 384 aa  90.9  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  29.62 
 
 		 435 aa  90.1  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  30.17 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  28.17 
 
 		 434 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 411 aa  87.8  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  26.67 
 
 		 402 aa  88.2  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 430 aa  87.4  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  24.08 
 
 		 375 aa  87.4  5e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  26.38 
 
 		 348 aa  86.3  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  26.46 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  30.75 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  29.17 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  29.83 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  29.89 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 409 aa  79.7  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  30.06 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  27.73 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  26.94 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  29.4 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1195  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 438 aa  76.3  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  29.12 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  30.22 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  29.12 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  28.45 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  28.14 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  28.96 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  27.35 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0431  hypothetical protein  28.27 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.446535  normal  0.169558 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  29.23 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  23.82 
 
 		 396 aa  72.8  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  30.13 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  23.88 
 
 		 379 aa  71.6  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  26.46 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1774  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.496071 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  27.25 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  26.02 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  26.46 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  24.48 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  26.65 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  25.75 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  25.76 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  26.67 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  25.71 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  29.97 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  27.15 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1540  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  25.57 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  27.51 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  26.33 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  24.04 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>