More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0938 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  82.74 
 
 		 453 aa  811    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0811  geranylgeranyl reductase  81.46 
 
 		 453 aa  755    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  81.96 
 
 		 452 aa  796    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 453 aa  920    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  51.84 
 
 		 459 aa  440  9.999999999999999e-123  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  38.58 
 
 		 453 aa  313  3.9999999999999997e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0166  geranylgeranyl reductase  36.08 
 
 		 453 aa  300  4e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  31.46 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1514  geranylgeranyl reductase  27.06 
 
 		 485 aa  170  4e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00785047 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1413  geranylgeranyl reductase  31.56 
 
 		 456 aa  167  4e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.145276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1377  geranylgeranyl reductase  32.95 
 
 		 467 aa  167  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3127  geranylgeranyl reductase  30.47 
 
 		 458 aa  167  5e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.541663  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0881  geranylgeranyl reductase  30.65 
 
 		 455 aa  149  9e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170951  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1523  geranylgeranyl reductase  28.26 
 
 		 495 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545892  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2778  geranylgeranyl reductase  32.42 
 
 		 471 aa  145  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  30 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2954  geranylgeranyl reductase  29.6 
 
 		 457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  33.14 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  27.79 
 
 		 408 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  28.65 
 
 		 391 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  26.73 
 
 		 395 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  29.76 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  30.84 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  27.56 
 
 		 387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  29.5 
 
 		 399 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  28.41 
 
 		 414 aa  116  8.999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  31.4 
 
 		 397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 410 aa  113  7.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  27.59 
 
 		 390 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  27.85 
 
 		 390 aa  111  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  28.37 
 
 		 405 aa  110  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  27.88 
 
 		 407 aa  106  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  26.51 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  26.24 
 
 		 391 aa  101  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  27.03 
 
 		 390 aa  99.8  9e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 411 aa  95.1  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  28.57 
 
 		 396 aa  94  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  28.8 
 
 		 348 aa  94  6e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  27.25 
 
 		 418 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  24.24 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  24.51 
 
 		 375 aa  92  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  26.24 
 
 		 435 aa  90.5  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  26.87 
 
 		 457 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  27.17 
 
 		 424 aa  89  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  25.15 
 
 		 376 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  26.24 
 
 		 402 aa  88.2  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  29.11 
 
 		 423 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  24.76 
 
 		 409 aa  87.4  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  26.91 
 
 		 430 aa  87.4  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  27.14 
 
 		 434 aa  87  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  28.19 
 
 		 380 aa  86.7  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 		 365 aa  84.7  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  26.44 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.8 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  26.27 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1195  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  28.84 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  28.84 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  28.23 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  26.6 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  25.06 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  27.51 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  29.12 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  26.85 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  26.77 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  26.05 
 
 		 431 aa  76.6  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  26.02 
 
 		 445 aa  76.3  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  26.84 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  25.66 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1774  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.496071 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  28.85 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  26.97 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  25.81 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  30.22 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  27.41 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  25.86 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  30.09 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  27.71 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  25.71 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  30.37 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  26.41 
 
 		 379 aa  72  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  27.03 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  27.51 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  29.61 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  24.1 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  26.9 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  24.17 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  26.39 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  24.51 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  25 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>