163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1220 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  100 
 
 		 378 aa  766    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  28.07 
 
 		 386 aa  147  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  28.16 
 
 		 375 aa  142  8e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  29.43 
 
 		 399 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  29.68 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  29.82 
 
 		 392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  28.22 
 
 		 390 aa  125  9e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  28.88 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  28.92 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  27.98 
 
 		 391 aa  125  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  28.85 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  27.37 
 
 		 392 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  27.87 
 
 		 390 aa  123  5e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  27.97 
 
 		 396 aa  122  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  26.68 
 
 		 385 aa  122  9e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  29.4 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  29.32 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  29.41 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  27.3 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  27.64 
 
 		 395 aa  116  7.999999999999999e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  28.29 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  24.79 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  24.65 
 
 		 391 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  25.74 
 
 		 408 aa  109  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0783  monooxygenase, FAD-binding  26.11 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  29.63 
 
 		 388 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  25.32 
 
 		 384 aa  96.7  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  27.3 
 
 		 365 aa  96.3  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  26.67 
 
 		 407 aa  95.9  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  23.5 
 
 		 406 aa  94.7  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  26.58 
 
 		 398 aa  91.7  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  26.56 
 
 		 398 aa  89.7  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  25.41 
 
 		 397 aa  88.2  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  23.8 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  25.91 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  25.43 
 
 		 341 aa  82.8  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  25.14 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  24.86 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  24.86 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  23.05 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  26.25 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  24.05 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  24.22 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  25.83 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0893  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  25.15 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  27.71 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  24.67 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1933  hypothetical protein  26.15 
 
 		 358 aa  72  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  24.48 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  25.62 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  23.98 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  25.15 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  22.43 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  24.77 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  25.17 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  24.03 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  24.3 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2291  hypothetical protein  26.4 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0761399 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  23.08 
 
 		 408 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  23.04 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  23.29 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  23.15 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  23.68 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0269  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0349456 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  22.92 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6424  geranylgeranyl reductase  23.51 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2063  geranylgeranyl reductase  23.95 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104109 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  22.13 
 
 		 452 aa  63.9  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  21.93 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5367  geranylgeranyl reductase  22.88 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.707854 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1514  geranylgeranyl reductase  22.96 
 
 		 485 aa  63.5  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00785047 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  21.82 
 
 		 453 aa  63.2  0.000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  22.1 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  28.78 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1405  monooxygenase FAD-binding  23.03 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.144812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  24.75 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2544  geranylgeranyl reductase family protein  24.77 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2172  geranylgeranyl reductase  24.77 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.328813  decreased coverage  0.000000000712182 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  20.39 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  26.51 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5289  geranylgeranyl reductase  23.46 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0732  hypothetical protein  24.11 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  23.54 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  21.23 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  20.9 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  28.06 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  24.17 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4822  geranylgeranyl reductase  23.82 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.0333239 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2871  monooxygenase FAD-binding protein  23.18 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.618134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  20.11 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  21.49 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  21.34 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  21.35 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  21.01 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5207  monooxygenase, FAD-binding protein  22.19 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00824524  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  21.66 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  24.37 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>