More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0810 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  100 
 
 
384 aa  793    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  46.97 
 
 
382 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  50.66 
 
 
388 aa  342  9e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  49.58 
 
 
376 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  49.59 
 
 
385 aa  300  4e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  37.5 
 
 
399 aa  248  1e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  35.28 
 
 
416 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  34.4 
 
 
386 aa  194  3e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  30.1 
 
 
392 aa  176  6e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  29.67 
 
 
391 aa  173  5e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  31.44 
 
 
375 aa  172  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  29.53 
 
 
386 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  28.87 
 
 
385 aa  167  4e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  26.49 
 
 
392 aa  158  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  29.68 
 
 
361 aa  139  8.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  26.27 
 
 
408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  29.82 
 
 
362 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0269  geranylgeranyl reductase  29.47 
 
 
361 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0349456 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  30.36 
 
 
360 aa  129  7.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  27.59 
 
 
390 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  26.72 
 
 
390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  28 
 
 
399 aa  125  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  25.95 
 
 
406 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  30.33 
 
 
398 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  31.15 
 
 
369 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25.4 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  26.01 
 
 
390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  26.84 
 
 
407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  26.51 
 
 
379 aa  119  9e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  26.79 
 
 
390 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  25.73 
 
 
391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  24.44 
 
 
393 aa  117  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  25.21 
 
 
379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  25.45 
 
 
396 aa  109  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  26.72 
 
 
402 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  23.68 
 
 
391 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  27.93 
 
 
397 aa  107  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  27.11 
 
 
398 aa  107  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  25.27 
 
 
396 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  27.83 
 
 
341 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  25.32 
 
 
378 aa  101  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  24.94 
 
 
402 aa  99.8  8e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  27.14 
 
 
396 aa  99  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  27.2 
 
 
365 aa  96.7  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  26.65 
 
 
379 aa  94  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  24.62 
 
 
387 aa  92.8  9e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0732  hypothetical protein  26.06 
 
 
358 aa  86.3  8e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  27.02 
 
 
400 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  25.28 
 
 
379 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  26.73 
 
 
375 aa  83.6  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  26.63 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0783  monooxygenase, FAD-binding  26.93 
 
 
375 aa  82.8  0.000000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  23.33 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  23.98 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  22.55 
 
 
385 aa  77  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1933  hypothetical protein  25.71 
 
 
358 aa  77  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  24.23 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  25 
 
 
380 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  23.77 
 
 
421 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.24 
 
 
446 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  27.12 
 
 
405 aa  75.9  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  22.95 
 
 
406 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  22.52 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0893  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  24.73 
 
 
393 aa  75.1  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  25.37 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.03 
 
 
446 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  26.37 
 
 
389 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  25.29 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2291  hypothetical protein  25.91 
 
 
358 aa  73.2  0.000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0761399 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  24.44 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  28.89 
 
 
381 aa  72.8  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  21.98 
 
 
385 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.48 
 
 
446 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  24.19 
 
 
457 aa  72  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2805  monooxygenase FAD-binding protein  26.26 
 
 
369 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  25.57 
 
 
384 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  22.56 
 
 
445 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  26.45 
 
 
384 aa  70.5  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  25.14 
 
 
384 aa  70.5  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  23.68 
 
 
453 aa  70.1  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  22.83 
 
 
452 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  23.01 
 
 
380 aa  68.9  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  23.03 
 
 
363 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  23.03 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  26.9 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  22.63 
 
 
405 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  25.31 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  23.37 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  23.48 
 
 
380 aa  67  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  25.14 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  27.34 
 
 
394 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  23.29 
 
 
434 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  20.34 
 
 
413 aa  66.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  22.83 
 
 
455 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  24.66 
 
 
379 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  22.67 
 
 
458 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  23 
 
 
443 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.53 
 
 
449 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2063  hypothetical protein  24.91 
 
 
363 aa  64.7  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23 
 
 
443 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>