More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8053 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 423 aa  860    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  69.41 
 
 		 435 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  68.24 
 
 		 434 aa  595  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  68.35 
 
 		 424 aa  590  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  70.64 
 
 		 440 aa  584  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  66.27 
 
 		 425 aa  579  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  64.61 
 
 		 418 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  66.82 
 
 		 434 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  66.67 
 
 		 445 aa  569  1e-161  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  66.43 
 
 		 423 aa  560  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  66.67 
 
 		 423 aa  560  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  61.83 
 
 		 457 aa  541  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  59.43 
 
 		 431 aa  518  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  61.81 
 
 		 426 aa  515  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  58.91 
 
 		 430 aa  505  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  58.1 
 
 		 443 aa  491  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  58.49 
 
 		 430 aa  489  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  57.68 
 
 		 431 aa  488  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  54.06 
 
 		 431 aa  472  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  56.43 
 
 		 424 aa  464  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  54.27 
 
 		 443 aa  435  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  52.12 
 
 		 444 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  50.36 
 
 		 419 aa  395  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17730  geranylgeranyl reductase family protein  44.57 
 
 		 466 aa  344  1e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  37.29 
 
 		 436 aa  247  2e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  35.48 
 
 		 393 aa  203  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  35.31 
 
 		 393 aa  202  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  35.75 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  35.75 
 
 		 406 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  34.29 
 
 		 393 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  34.29 
 
 		 393 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5254  geranylgeranyl reductase  32.93 
 
 		 416 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  33.85 
 
 		 400 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  34.01 
 
 		 393 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1099  geranylgeranyl reductase  34.67 
 
 		 435 aa  180  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.997696  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10571  oxidoreductase  32.81 
 
 		 408 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649109  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0991  geranylgeranyl reductase  32.03 
 
 		 418 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0948  geranylgeranyl reductase  33.02 
 
 		 417 aa  169  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  35.27 
 
 		 415 aa  167  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  34.2 
 
 		 413 aa  160  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  33.81 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  34.67 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  35.19 
 
 		 420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  30.42 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  32.41 
 
 		 409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0164  putative electron transfer oxidoreductase  33.53 
 
 		 420 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  29.05 
 
 		 376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  32.62 
 
 		 425 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  29.49 
 
 		 398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  33 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  34.04 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  30.52 
 
 		 414 aa  111  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  28.74 
 
 		 382 aa  111  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  30.93 
 
 		 409 aa  110  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  33.04 
 
 		 378 aa  107  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  27.86 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  28.1 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  30.79 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  26.12 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  28.66 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  25.93 
 
 		 387 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  28.85 
 
 		 408 aa  100  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  32.14 
 
 		 429 aa  100  7e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  27.69 
 
 		 390 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  28.74 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  27.08 
 
 		 444 aa  97.1  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  31.88 
 
 		 384 aa  97.1  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  31.17 
 
 		 406 aa  96.7  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  26.34 
 
 		 370 aa  96.7  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  29.29 
 
 		 407 aa  96.3  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  30.42 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  27.95 
 
 		 396 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  32.05 
 
 		 400 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  27.3 
 
 		 362 aa  93.2  8e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  28.4 
 
 		 362 aa  93.2  8e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  25.43 
 
 		 444 aa  92.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  30.96 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  31.63 
 
 		 368 aa  92.8  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  29.54 
 
 		 385 aa  92.8  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  26.89 
 
 		 375 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  27.89 
 
 		 402 aa  91.3  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  30.86 
 
 		 452 aa  91.3  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  31.3 
 
 		 403 aa  91.7  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0327  geranylgeranyl reductase  32.21 
 
 		 373 aa  90.9  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.252383  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.74 
 
 		 455 aa  90.1  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  27.56 
 
 		 390 aa  89.7  8e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  28.72 
 
 		 394 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  28.97 
 
 		 376 aa  89.4  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  28.72 
 
 		 394 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  27.5 
 
 		 395 aa  89  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0808  geranylgeranyl reductase  30.82 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  hitchhiker  0.000310699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  29.53 
 
 		 365 aa  87.8  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 438 aa  87.4  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  31.98 
 
 		 401 aa  87.4  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  28.65 
 
 		 453 aa  87.4  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  26.63 
 
 		 391 aa  86.7  7e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.25 
 
 		 445 aa  86.7  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  28.21 
 
 		 380 aa  86.7  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  27.2 
 
 		 387 aa  86.7  8e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>