More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0369 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 408 aa  832    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  66.5 
 
 		 406 aa  556  1e-157  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  60.85 
 
 		 407 aa  499  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  54.67 
 
 		 391 aa  420  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  48.85 
 
 		 399 aa  376  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  46.7 
 
 		 397 aa  353  2e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  46.89 
 
 		 402 aa  353  4e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  48.18 
 
 		 398 aa  345  8e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  45.55 
 
 		 398 aa  334  2e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  41.12 
 
 		 395 aa  297  3e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  40 
 
 		 390 aa  270  4e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  39.65 
 
 		 390 aa  266  5e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  40.25 
 
 		 390 aa  266  7e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  39.65 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  38.52 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  33.52 
 
 		 399 aa  202  6e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  35.75 
 
 		 396 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  34.5 
 
 		 387 aa  196  9e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  31.13 
 
 		 386 aa  169  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  34.34 
 
 		 396 aa  166  8e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  32.73 
 
 		 402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  32 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  32.76 
 
 		 382 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  30.26 
 
 		 392 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  33.62 
 
 		 365 aa  146  6e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  28.79 
 
 		 386 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 		 385 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  29.49 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  32.55 
 
 		 341 aa  142  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  29.38 
 
 		 452 aa  139  7e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  28.09 
 
 		 392 aa  139  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  30.92 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  28.88 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  26.59 
 
 		 396 aa  134  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  30.31 
 
 		 458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  30.51 
 
 		 381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  28.26 
 
 		 385 aa  126  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  26.27 
 
 		 384 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  26.32 
 
 		 375 aa  124  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  27.79 
 
 		 453 aa  123  5e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  30.36 
 
 		 435 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  29.03 
 
 		 459 aa  117  5e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  29.2 
 
 		 418 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0811  geranylgeranyl reductase  27.95 
 
 		 453 aa  113  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  28.98 
 
 		 376 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  28.74 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  30.23 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  28.86 
 
 		 425 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 		 424 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  27.79 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  25.74 
 
 		 378 aa  109  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  29.33 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  26.83 
 
 		 398 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  28.87 
 
 		 360 aa  106  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  26.45 
 
 		 405 aa  106  9e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  27.23 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  30 
 
 		 434 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  30.72 
 
 		 362 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  24.63 
 
 		 409 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.79 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  29.27 
 
 		 426 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  29.24 
 
 		 445 aa  102  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  29.24 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  27.53 
 
 		 393 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  28.01 
 
 		 421 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  28.93 
 
 		 434 aa  100  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  24.79 
 
 		 453 aa  100  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  28.85 
 
 		 423 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2954  geranylgeranyl reductase  30.81 
 
 		 457 aa  100  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  31.21 
 
 		 420 aa  99.4  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  29.67 
 
 		 361 aa  99.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  28.85 
 
 		 398 aa  99.4  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  30.48 
 
 		 360 aa  99.4  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 		 413 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  26.74 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  28.7 
 
 		 369 aa  98.6  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  27.34 
 
 		 385 aa  98.2  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  27.57 
 
 		 376 aa  98.6  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  28.4 
 
 		 398 aa  97.8  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  28.41 
 
 		 423 aa  96.7  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  28.45 
 
 		 432 aa  96.7  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1514  geranylgeranyl reductase  25.44 
 
 		 485 aa  95.9  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00785047 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  26.8 
 
 		 431 aa  95.9  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  29.57 
 
 		 430 aa  95.5  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  26.58 
 
 		 393 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  23.66 
 
 		 410 aa  94.7  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0881  geranylgeranyl reductase  27.41 
 
 		 455 aa  95.1  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170951  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  28.89 
 
 		 423 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 430 aa  94.7  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  27.75 
 
 		 457 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3127  geranylgeranyl reductase  29.03 
 
 		 458 aa  94.7  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.541663  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  29.66 
 
 		 394 aa  94.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  28.38 
 
 		 431 aa  94  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  22.45 
 
 		 414 aa  93.6  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  23.9 
 
 		 413 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  30.06 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  29.47 
 
 		 409 aa  92  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0783  monooxygenase, FAD-binding  26.08 
 
 		 375 aa  91.7  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  30.06 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>