More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0648 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 430 aa  852    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  61.07 
 
 		 435 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  60.28 
 
 		 434 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  60.99 
 
 		 434 aa  513  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  59.72 
 
 		 425 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  58.91 
 
 		 423 aa  505  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  59.72 
 
 		 431 aa  507  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  59.39 
 
 		 424 aa  503  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  59.91 
 
 		 431 aa  501  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  60.05 
 
 		 443 aa  491  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  61.05 
 
 		 440 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  58.63 
 
 		 445 aa  482  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  55.71 
 
 		 418 aa  478  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  59.62 
 
 		 443 aa  474  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  57.38 
 
 		 423 aa  471  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  56.71 
 
 		 423 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  57.94 
 
 		 444 aa  458  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  54.23 
 
 		 457 aa  456  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  54.31 
 
 		 431 aa  451  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  56.03 
 
 		 426 aa  447  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  55.29 
 
 		 430 aa  441  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  53.63 
 
 		 424 aa  421  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  50.12 
 
 		 419 aa  386  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17730  geranylgeranyl reductase family protein  48.05 
 
 		 466 aa  340  4e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  37.16 
 
 		 436 aa  218  1e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1099  geranylgeranyl reductase  35.97 
 
 		 435 aa  182  7e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.997696  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5254  geranylgeranyl reductase  33.57 
 
 		 416 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  36.17 
 
 		 406 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  36.17 
 
 		 406 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  34.37 
 
 		 400 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0948  geranylgeranyl reductase  35.5 
 
 		 417 aa  171  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0991  geranylgeranyl reductase  31.91 
 
 		 418 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10571  oxidoreductase  31.52 
 
 		 408 aa  167  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649109  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  31.97 
 
 		 393 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  32.03 
 
 		 393 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  39.33 
 
 		 413 aa  153  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  33.02 
 
 		 415 aa  147  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  31.71 
 
 		 393 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  31.71 
 
 		 393 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  31.46 
 
 		 393 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  30.81 
 
 		 376 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  35.42 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  26.84 
 
 		 384 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  29.68 
 
 		 398 aa  131  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  29.85 
 
 		 398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  35.31 
 
 		 375 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  28.81 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  33.33 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  32.21 
 
 		 409 aa  110  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  33.14 
 
 		 425 aa  110  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  31.55 
 
 		 414 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  32.75 
 
 		 409 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  27.65 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  31.76 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  25.65 
 
 		 376 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  33.02 
 
 		 429 aa  100  5e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  28.05 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  25.86 
 
 		 370 aa  100  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0164  putative electron transfer oxidoreductase  32.16 
 
 		 420 aa  97.8  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 408 aa  94.7  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  30.16 
 
 		 389 aa  94.7  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  32.01 
 
 		 403 aa  94.7  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  29.64 
 
 		 385 aa  93.6  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  25.48 
 
 		 368 aa  92.8  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  30.96 
 
 		 384 aa  92  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  27.59 
 
 		 452 aa  90.5  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  29.41 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  28.78 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  30.61 
 
 		 413 aa  89.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  27.98 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  26.72 
 
 		 402 aa  89  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0808  geranylgeranyl reductase  30.86 
 
 		 406 aa  87.4  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  hitchhiker  0.000310699 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  30.59 
 
 		 400 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  28.64 
 
 		 376 aa  87  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  29.81 
 
 		 401 aa  87  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  25.89 
 
 		 390 aa  87  6e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  29.94 
 
 		 405 aa  86.7  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  30.62 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  28.31 
 
 		 495 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  25.95 
 
 		 444 aa  86.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  29.85 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  26.37 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  29.38 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  23.64 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  24.38 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  27.73 
 
 		 453 aa  83.2  0.000000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  27.75 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  26.65 
 
 		 396 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  27.25 
 
 		 455 aa  81.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  26.67 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  22.55 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  29.92 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.72 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  32.87 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  24.87 
 
 		 415 aa  79.7  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  27.01 
 
 		 444 aa  79.7  0.00000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  26.76 
 
 		 398 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  29.6 
 
 		 367 aa  79.7  0.00000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>