231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1007 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
409 aa  837    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  64.46 
 
 
413 aa  555  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  63.81 
 
 
414 aa  553  1e-156  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  64.3 
 
 
411 aa  554  1e-156  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  63.55 
 
 
410 aa  532  1e-150  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  60.15 
 
 
410 aa  530  1e-149  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  40.72 
 
 
405 aa  224  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0431  hypothetical protein  28.68 
 
 
422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.446535  normal  0.169558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  29.07 
 
 
399 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  25.97 
 
 
406 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  24.63 
 
 
408 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  26.67 
 
 
402 aa  102  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  28.1 
 
 
398 aa  100  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  29.04 
 
 
407 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  28.65 
 
 
393 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  27.81 
 
 
390 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  28.17 
 
 
390 aa  97.8  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  28.65 
 
 
393 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  25.97 
 
 
398 aa  94.7  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  26.53 
 
 
390 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  25.63 
 
 
390 aa  90.5  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  26.43 
 
 
398 aa  90.1  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  24.87 
 
 
402 aa  88.6  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  25.88 
 
 
453 aa  87.8  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  24.41 
 
 
391 aa  87.4  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  29.71 
 
 
398 aa  87  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  25.53 
 
 
396 aa  87  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  29.78 
 
 
393 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  29.78 
 
 
393 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  29.94 
 
 
397 aa  85.1  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  29.78 
 
 
393 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  23.71 
 
 
395 aa  82.8  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  25.12 
 
 
452 aa  82  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15361  NAD binding site  26.65 
 
 
405 aa  79.7  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.298365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  26.2 
 
 
424 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4688  monooxygenase FAD-binding  23.91 
 
 
417 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  25.36 
 
 
425 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1429  hypothetical protein  26.87 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0716636 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  25.89 
 
 
459 aa  78.2  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  27.12 
 
 
423 aa  76.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  26.74 
 
 
418 aa  76.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  24.32 
 
 
386 aa  76.3  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  26.76 
 
 
379 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  30 
 
 
445 aa  75.1  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08531  dehydrogenases (flavoproteins)  23.98 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.741714  hitchhiker  0.00186449 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  25 
 
 
434 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  25.45 
 
 
387 aa  74.3  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  27.81 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  25.42 
 
 
435 aa  73.6  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  24.76 
 
 
453 aa  73.2  0.000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  29.17 
 
 
430 aa  73.2  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  24.58 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.69 
 
 
432 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  26.27 
 
 
406 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  20.31 
 
 
392 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 
431 aa  71.6  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  20.94 
 
 
385 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  27.17 
 
 
430 aa  70.5  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  27.48 
 
 
421 aa  69.7  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  24.51 
 
 
413 aa  69.7  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  24.65 
 
 
382 aa  68.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  25.63 
 
 
431 aa  68.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  21.7 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  26.36 
 
 
413 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  26.36 
 
 
378 aa  67  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  22.74 
 
 
384 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  20.35 
 
 
391 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  21.45 
 
 
375 aa  65.5  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  26.67 
 
 
425 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  26.12 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 
376 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  25.84 
 
 
423 aa  63.9  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  26.86 
 
 
434 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  24.06 
 
 
461 aa  63.2  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  24.31 
 
 
415 aa  63.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  23.14 
 
 
399 aa  63.2  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  25.7 
 
 
423 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  26.26 
 
 
457 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  26.3 
 
 
419 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  23.12 
 
 
458 aa  62.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  24.51 
 
 
441 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  28.26 
 
 
409 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  24.53 
 
 
495 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  25.9 
 
 
362 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  27.64 
 
 
384 aa  60.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1514  geranylgeranyl reductase  22.69 
 
 
485 aa  60.5  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00785047 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  22.47 
 
 
379 aa  60.1  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  24.11 
 
 
368 aa  60.1  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  25.23 
 
 
375 aa  60.1  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  27.06 
 
 
440 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  18.02 
 
 
392 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  25.51 
 
 
414 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  25.98 
 
 
405 aa  58.9  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  22.87 
 
 
387 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  25.45 
 
 
436 aa  58.2  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  21.39 
 
 
379 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  23.92 
 
 
431 aa  58.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  25.64 
 
 
417 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  22.16 
 
 
377 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>