237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0472 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 385 aa  777    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  91.69 
 
 		 392 aa  724    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  89.38 
 
 		 386 aa  702    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  74.23 
 
 		 391 aa  600  1e-170  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  58.1 
 
 		 392 aa  449  1e-125  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  31.98 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  30.93 
 
 		 386 aa  189  8e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  33.16 
 
 		 382 aa  177  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  32.15 
 
 		 390 aa  176  7e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  31.77 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  30.37 
 
 		 375 aa  170  4e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  29.29 
 
 		 416 aa  169  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  31.51 
 
 		 391 aa  168  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  31.87 
 
 		 390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  30.77 
 
 		 390 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  28.42 
 
 		 384 aa  162  9e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  31.27 
 
 		 388 aa  159  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  29.23 
 
 		 376 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 		 408 aa  142  9e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  27.03 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  28.25 
 
 		 406 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  26.5 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  26.3 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  25.53 
 
 		 396 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  25.65 
 
 		 396 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  27.65 
 
 		 395 aa  123  5e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  26.68 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  26.49 
 
 		 407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0783  monooxygenase, FAD-binding  25.59 
 
 		 375 aa  114  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  22.95 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  24.68 
 
 		 369 aa  101  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  25.81 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  24.75 
 
 		 362 aa  98.6  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  23.98 
 
 		 393 aa  97.1  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  23.66 
 
 		 398 aa  96.7  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  22.49 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  25.77 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  20.97 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  23.04 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0732  hypothetical protein  26.45 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0893  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  25.33 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  23.99 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  21.84 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0269  geranylgeranyl reductase  23.68 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0349456 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.43 
 
 		 446 aa  80.9  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.51 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.85 
 
 		 446 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  23.53 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  24.5 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25.54 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  25.82 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2291  hypothetical protein  23.18 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0761399 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  23.44 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1933  hypothetical protein  24.58 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2063  hypothetical protein  24.01 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  21.78 
 
 		 410 aa  72.8  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.87 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  20.94 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  22.57 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  20.75 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  22.94 
 
 		 365 aa  71.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  24.08 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  22.06 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  25.3 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  22.02 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  25.16 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  24.19 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  25.39 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  22.8 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  25.64 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.39 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  25.64 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  23.96 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  23.96 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  25.6 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  24.4 
 
 		 406 aa  66.2  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  21.13 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  24.7 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  23.23 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  23.4 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.78 
 
 		 468 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  25.67 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  25.67 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  23.08 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  25.67 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  25.3 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  21.56 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  25.82 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  24.42 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5207  monooxygenase, FAD-binding protein  22.09 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00824524  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  27.1 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  22.45 
 
 		 384 aa  62.8  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5254  geranylgeranyl reductase  25.81 
 
 		 416 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  22.83 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2172  geranylgeranyl reductase  24.07 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.328813  decreased coverage  0.000000000712182 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2544  geranylgeranyl reductase family protein  24.07 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  22.51 
 
 		 363 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.38 
 
 		 449 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>