More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1123 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 402 aa  820    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  63.18 
 
 		 399 aa  519  1e-146  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  61.38 
 
 		 398 aa  490  1e-137  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  61.98 
 
 		 398 aa  476  1e-133  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  61.03 
 
 		 397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  48.7 
 
 		 406 aa  387  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  50 
 
 		 407 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  46.89 
 
 		 408 aa  370  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  46.52 
 
 		 391 aa  355  1e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  44.9 
 
 		 395 aa  319  6e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  38.17 
 
 		 390 aa  236  6e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  37.74 
 
 		 391 aa  232  1e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  37.66 
 
 		 390 aa  223  4e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  37.66 
 
 		 390 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  35.88 
 
 		 390 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  32.92 
 
 		 387 aa  182  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  30.07 
 
 		 399 aa  167  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  32.55 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  31.14 
 
 		 416 aa  146  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  26.37 
 
 		 386 aa  138  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  29.06 
 
 		 382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  29.86 
 
 		 375 aa  132  6.999999999999999e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  29.12 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  30.1 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  27.25 
 
 		 396 aa  125  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  29.86 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  31.34 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  29.76 
 
 		 453 aa  125  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  28.38 
 
 		 452 aa  124  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  30.91 
 
 		 459 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  26.06 
 
 		 392 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  26.33 
 
 		 386 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  28.92 
 
 		 453 aa  120  4.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  32.84 
 
 		 341 aa  119  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  25.87 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  26.44 
 
 		 384 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  29.37 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  25.13 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 414 aa  113  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  32.29 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 		 410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0811  geranylgeranyl reductase  28.03 
 
 		 453 aa  106  9e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 		 409 aa  104  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  27.99 
 
 		 406 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  28.65 
 
 		 398 aa  98.2  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  30.57 
 
 		 360 aa  97.8  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  25.14 
 
 		 379 aa  97.4  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  25.42 
 
 		 406 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  31.19 
 
 		 348 aa  95.1  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  25.14 
 
 		 378 aa  94  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0166  geranylgeranyl reductase  26.4 
 
 		 453 aa  93.2  8e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  28.23 
 
 		 379 aa  92.8  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  28.11 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  25.2 
 
 		 376 aa  91.3  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 393 aa  91.3  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  28.99 
 
 		 435 aa  90.1  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 385 aa  89.7  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1514  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 485 aa  89.4  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00785047 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  26.25 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  25.06 
 
 		 421 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  26.06 
 
 		 455 aa  89.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  27.49 
 
 		 384 aa  89  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  24.64 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  23.33 
 
 		 405 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 411 aa  87.8  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  29.38 
 
 		 445 aa  87.4  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  26.99 
 
 		 394 aa  86.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  26.99 
 
 		 394 aa  86.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  25.12 
 
 		 407 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  24.4 
 
 		 418 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  26.25 
 
 		 398 aa  86.3  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  24.24 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  24.29 
 
 		 457 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2172  geranylgeranyl reductase  32.55 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.328813  decreased coverage  0.000000000712182 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2544  geranylgeranyl reductase family protein  32.55 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  27.97 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  27.76 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  28.42 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  26.76 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  25.65 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.48 
 
 		 446 aa  83.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  27.44 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  29.58 
 
 		 411 aa  83.2  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  28.84 
 
 		 431 aa  82.8  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  27.75 
 
 		 424 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  29.66 
 
 		 434 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  28.12 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1523  geranylgeranyl reductase  26.03 
 
 		 495 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545892  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  27.05 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.92 
 
 		 446 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  23.87 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  27.08 
 
 		 458 aa  81.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  27.49 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  26.65 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  27.75 
 
 		 379 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>