279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0385 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  85.15 
 
 		 405 aa  711    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  83.54 
 
 		 407 aa  692    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  81.13 
 
 		 418 aa  694    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  83 
 
 		 406 aa  707    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  74.16 
 
 		 452 aa  643    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  73.92 
 
 		 455 aa  640    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  85.15 
 
 		 405 aa  713    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 457 aa  939    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  82.27 
 
 		 406 aa  699    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  85.15 
 
 		 405 aa  711    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  71.77 
 
 		 446 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  71.77 
 
 		 446 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  70.81 
 
 		 446 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  73.44 
 
 		 449 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  69.45 
 
 		 468 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  70.81 
 
 		 445 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  70.81 
 
 		 443 aa  578  1e-164  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  70.81 
 
 		 443 aa  578  1e-164  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119498  geranylgeranyl reductase  64.16 
 
 		 462 aa  548  1e-155  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50650  predicted protein  59.73 
 
 		 463 aa  498  1e-140  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  45.3 
 
 		 421 aa  338  8e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  43.5 
 
 		 406 aa  313  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  42 
 
 		 406 aa  307  3e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  42.04 
 
 		 379 aa  290  5.0000000000000004e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  41.04 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  42.25 
 
 		 379 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  39.9 
 
 		 380 aa  270  4e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  39.05 
 
 		 380 aa  269  7e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  40.3 
 
 		 380 aa  264  3e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  38.96 
 
 		 380 aa  263  6e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  37.75 
 
 		 400 aa  242  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  39.39 
 
 		 394 aa  239  6.999999999999999e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  37.87 
 
 		 394 aa  232  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  37.87 
 
 		 394 aa  232  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0167  geranylgeranyl reductase  37.85 
 
 		 393 aa  230  4e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  35.97 
 
 		 400 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  38.37 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  37.53 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  36.18 
 
 		 401 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2063  geranylgeranyl reductase  36.39 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104109 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  36.39 
 
 		 402 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5367  geranylgeranyl reductase  36.34 
 
 		 397 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.707854 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  38.48 
 
 		 405 aa  211  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  34.7 
 
 		 408 aa  209  9e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6424  geranylgeranyl reductase  35.42 
 
 		 403 aa  206  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5289  geranylgeranyl reductase  36.97 
 
 		 397 aa  205  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4822  geranylgeranyl reductase  36.97 
 
 		 397 aa  204  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.0333239 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2779  geranylgeranyl reductase  37.69 
 
 		 330 aa  199  7e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0629  geranylgeranyl reductase  34.16 
 
 		 413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978932  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 390 aa  108  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  29.38 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  29.29 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  27.89 
 
 		 390 aa  100  7e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  27.92 
 
 		 375 aa  97.8  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  26.1 
 
 		 387 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  26.39 
 
 		 390 aa  96.3  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  26.98 
 
 		 390 aa  94.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  25.91 
 
 		 391 aa  90.5  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  26.73 
 
 		 396 aa  90.9  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25.45 
 
 		 395 aa  89.4  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  28.1 
 
 		 424 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  27.75 
 
 		 382 aa  87.8  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  26.26 
 
 		 396 aa  87.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  24.36 
 
 		 391 aa  86.7  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.49 
 
 		 389 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  27.87 
 
 		 418 aa  86.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  27.98 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  26.52 
 
 		 348 aa  82.8  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  26.05 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  26.88 
 
 		 419 aa  83.2  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  26.11 
 
 		 374 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  27.62 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  27.11 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  27.94 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  26.33 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  27.59 
 
 		 445 aa  78.2  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  26.3 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1370  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  26.92 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  29.18 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  23.32 
 
 		 408 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  28.53 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1434  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  25.68 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000988984  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  26.54 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  23.43 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  27.66 
 
 		 384 aa  72.8  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  28.22 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  22.96 
 
 		 457 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  26.13 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  25.29 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  29.18 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  26.33 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  26.98 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  23.04 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08531  dehydrogenases (flavoproteins)  25.62 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.741714  hitchhiker  0.00186449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2315  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  26.79 
 
 		 436 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0377746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  26.77 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  23.78 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  26.42 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  26.54 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  23.82 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>