More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1042 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 388 aa  784    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  61.56 
 
 		 376 aa  430  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  55.76 
 
 		 382 aa  412  1e-114  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  56.59 
 
 		 385 aa  368  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  50.66 
 
 		 384 aa  364  1e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  41.73 
 
 		 399 aa  258  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  37.7 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  37.02 
 
 		 416 aa  208  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  30.71 
 
 		 392 aa  184  3e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  29.09 
 
 		 392 aa  182  7e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  31.51 
 
 		 385 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  32.62 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  31.5 
 
 		 391 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  30.65 
 
 		 386 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  26.55 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  31.32 
 
 		 396 aa  142  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  28.74 
 
 		 408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  32.1 
 
 		 361 aa  139  8.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  31.09 
 
 		 362 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0269  geranylgeranyl reductase  31.38 
 
 		 361 aa  136  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0349456 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  25.25 
 
 		 390 aa  130  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  34.26 
 
 		 369 aa  129  9.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  30.89 
 
 		 396 aa  124  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  31.9 
 
 		 360 aa  123  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  28.43 
 
 		 406 aa  123  6e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  29.62 
 
 		 378 aa  123  6e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  26.56 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  32.62 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  25.98 
 
 		 391 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  27.12 
 
 		 390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  25.49 
 
 		 393 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  26.22 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  30.75 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  28.22 
 
 		 399 aa  110  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  27.2 
 
 		 395 aa  109  9.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  26.45 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  25.26 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  27.93 
 
 		 398 aa  106  8e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  26.63 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  29.68 
 
 		 407 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  29.26 
 
 		 398 aa  103  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  24.23 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  30.97 
 
 		 365 aa  100  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  30.84 
 
 		 360 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  28.11 
 
 		 402 aa  99.8  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0783  monooxygenase, FAD-binding  30.13 
 
 		 375 aa  99.4  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  27.9 
 
 		 387 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  30.19 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  30.19 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  28.31 
 
 		 363 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0732  hypothetical protein  27.24 
 
 		 358 aa  89  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  30.63 
 
 		 375 aa  87.8  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  28.12 
 
 		 379 aa  87.4  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  28.71 
 
 		 380 aa  87  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  29.89 
 
 		 398 aa  85.9  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  27.62 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  29.82 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  28.7 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  28.83 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  25.3 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  28.16 
 
 		 380 aa  82.8  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  29.03 
 
 		 400 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  24.11 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2063  hypothetical protein  29.29 
 
 		 363 aa  82  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  26.98 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5207  monooxygenase, FAD-binding protein  27.62 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00824524  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  25.98 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  27.94 
 
 		 380 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  29.49 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  24.71 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2544  geranylgeranyl reductase family protein  29.78 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2172  geranylgeranyl reductase  29.78 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.328813  decreased coverage  0.000000000712182 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1933  hypothetical protein  28.67 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  27.33 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  28.95 
 
 		 384 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0893  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  25.07 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.64 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  26.02 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  27.86 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0167  geranylgeranyl reductase  29.14 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  21.77 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  29.14 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2805  monooxygenase FAD-binding protein  26.83 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  30.62 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  23.61 
 
 		 385 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  25.64 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.34 
 
 		 468 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.83 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.78 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  26.07 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  29.03 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  25.5 
 
 		 413 aa  69.7  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  28.44 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  22.61 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  25.96 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2291  hypothetical protein  26.97 
 
 		 358 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0761399 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  28.85 
 
 		 400 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  26.78 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  28.05 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>