More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3265 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 406 aa  835    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  94.09 
 
 		 406 aa  789    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  65.74 
 
 		 421 aa  530  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  43.25 
 
 		 406 aa  320  1.9999999999999998e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  43 
 
 		 406 aa  314  9.999999999999999e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  43.5 
 
 		 457 aa  313  2.9999999999999996e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  43.25 
 
 		 418 aa  312  5.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  43 
 
 		 407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  42.89 
 
 		 405 aa  309  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  42.68 
 
 		 405 aa  308  9e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  42.89 
 
 		 405 aa  308  9e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  41.15 
 
 		 446 aa  305  8.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  41.04 
 
 		 446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  40.4 
 
 		 446 aa  302  8.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  40.58 
 
 		 468 aa  296  6e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  41.04 
 
 		 455 aa  293  3e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  41.32 
 
 		 445 aa  290  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  41.22 
 
 		 449 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  39.05 
 
 		 452 aa  288  1e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119498  geranylgeranyl reductase  40 
 
 		 462 aa  276  4e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  40.79 
 
 		 443 aa  275  8e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  40.79 
 
 		 443 aa  275  8e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  38.87 
 
 		 380 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  37.37 
 
 		 379 aa  246  8e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  37.01 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  38.06 
 
 		 380 aa  243  5e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  37.63 
 
 		 380 aa  242  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  37.5 
 
 		 380 aa  242  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  37.66 
 
 		 380 aa  239  4e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50650  predicted protein  35.23 
 
 		 463 aa  238  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  35.64 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  36.25 
 
 		 400 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  35.26 
 
 		 394 aa  210  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  35.26 
 
 		 394 aa  210  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  36.05 
 
 		 400 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  35.71 
 
 		 394 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  35.39 
 
 		 401 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0167  geranylgeranyl reductase  32.71 
 
 		 393 aa  193  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  33.78 
 
 		 400 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  34.21 
 
 		 405 aa  186  5e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  34.17 
 
 		 402 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2063  geranylgeranyl reductase  34.12 
 
 		 399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6424  geranylgeranyl reductase  31.58 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5367  geranylgeranyl reductase  33.71 
 
 		 397 aa  172  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.707854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4822  geranylgeranyl reductase  32.19 
 
 		 397 aa  168  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.0333239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5289  geranylgeranyl reductase  32.55 
 
 		 397 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2779  geranylgeranyl reductase  34.46 
 
 		 330 aa  168  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  33.06 
 
 		 408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0629  geranylgeranyl reductase  35.22 
 
 		 413 aa  166  8e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978932  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  35.71 
 
 		 375 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  31.9 
 
 		 378 aa  111  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  28.73 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  25.5 
 
 		 387 aa  106  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  26.62 
 
 		 370 aa  103  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  27.51 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  26.74 
 
 		 408 aa  98.6  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  26.99 
 
 		 395 aa  97.1  5e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  31.94 
 
 		 379 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  22.87 
 
 		 396 aa  95.1  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  24.29 
 
 		 391 aa  93.2  8e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  31.27 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 418 aa  90.9  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  31.96 
 
 		 419 aa  90.5  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  27.76 
 
 		 406 aa  90.1  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  29.84 
 
 		 424 aa  89.7  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 		 382 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  29.75 
 
 		 423 aa  87  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  26.81 
 
 		 382 aa  87  6e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  28.29 
 
 		 381 aa  86.3  9e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  30.51 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  31.89 
 
 		 363 aa  85.5  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  25.57 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  25.86 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  25.86 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  30.22 
 
 		 341 aa  82.8  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  26.77 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  29.66 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  27.53 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  28.14 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  26.58 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  25.95 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  26.34 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  28.07 
 
 		 423 aa  79.7  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  24.43 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  25.86 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  28.44 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  27.64 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  29.17 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  25.73 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  25.08 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  25.61 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  30.91 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  28.31 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  26.86 
 
 		 407 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  28 
 
 		 365 aa  75.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  27.3 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  28.43 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  25.54 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>