More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1073 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0811  geranylgeranyl reductase  85.11 
 
 		 453 aa  766    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  82.85 
 
 		 453 aa  790    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 452 aa  921    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  81.96 
 
 		 453 aa  776    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  50.88 
 
 		 459 aa  422  1e-117  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  36.05 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0166  geranylgeranyl reductase  35.38 
 
 		 453 aa  299  7e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  32.16 
 
 		 458 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1413  geranylgeranyl reductase  32.1 
 
 		 456 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.145276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1514  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 		 485 aa  163  6e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00785047 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3127  geranylgeranyl reductase  31.58 
 
 		 458 aa  161  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.541663  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1377  geranylgeranyl reductase  32.05 
 
 		 467 aa  160  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0881  geranylgeranyl reductase  32.58 
 
 		 455 aa  154  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170951  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2954  geranylgeranyl reductase  31.51 
 
 		 457 aa  153  7e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2778  geranylgeranyl reductase  31.75 
 
 		 471 aa  149  8e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  30.43 
 
 		 406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  29.38 
 
 		 408 aa  139  7e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  32.06 
 
 		 398 aa  140  7e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1523  geranylgeranyl reductase  30.19 
 
 		 495 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545892  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 		 395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  30.61 
 
 		 398 aa  127  6e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  28.69 
 
 		 391 aa  125  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  28.16 
 
 		 387 aa  125  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  31.18 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  28.41 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  27.65 
 
 		 402 aa  113  9e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  28.82 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  27.17 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 		 414 aa  102  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  28.5 
 
 		 390 aa  100  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  30.95 
 
 		 418 aa  100  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  28.41 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  27.82 
 
 		 390 aa  97.4  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  29.63 
 
 		 457 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 425 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  24.27 
 
 		 413 aa  94.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  25.61 
 
 		 384 aa  93.2  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  27.57 
 
 		 365 aa  92.8  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  25.18 
 
 		 375 aa  91.7  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  30.86 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  30.37 
 
 		 434 aa  91.3  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  28.61 
 
 		 435 aa  90.9  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  27.59 
 
 		 430 aa  90.5  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  27.23 
 
 		 390 aa  90.5  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  31.23 
 
 		 426 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  27.21 
 
 		 390 aa  89  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  28.81 
 
 		 424 aa  87.8  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  26.44 
 
 		 391 aa  86.7  9e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  28.47 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  25.67 
 
 		 376 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  29.61 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  25.66 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  29.78 
 
 		 430 aa  82.8  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  25.37 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  28.94 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  27.52 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  27.54 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  29.46 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  27.92 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  25.4 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  29.38 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  27.71 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  30.28 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  27.59 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  27.82 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  25.54 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  30.92 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  26.86 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  27.61 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 429 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0431  hypothetical protein  25.68 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.446535  normal  0.169558 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  24.38 
 
 		 379 aa  71.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  26.99 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  25.3 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0958  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  26.27 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  28.44 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  23.97 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  24 
 
 		 495 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  29.01 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  26.62 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  29.3 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  26.63 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  25.18 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  26.47 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  31.12 
 
 		 424 aa  69.7  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  29.01 
 
 		 394 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  25.3 
 
 		 414 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  26.78 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  29.01 
 
 		 394 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  27.06 
 
 		 361 aa  69.7  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  27.38 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0060  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012744 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  26.78 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  25.57 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>