208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_677 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  82.06 
 
 		 379 aa  649    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  80.47 
 
 		 393 aa  644    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  781    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  27.32 
 
 		 399 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  26.38 
 
 		 386 aa  138  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  29.08 
 
 		 375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  25.79 
 
 		 382 aa  107  5e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  26.67 
 
 		 416 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 		 396 aa  99.8  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0783  monooxygenase, FAD-binding  25.55 
 
 		 375 aa  96.7  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 		 391 aa  94  4e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  26.87 
 
 		 365 aa  94  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  23.76 
 
 		 386 aa  93.6  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  26.81 
 
 		 375 aa  90.5  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  23.06 
 
 		 392 aa  90.5  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  25.62 
 
 		 376 aa  89.7  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  25.22 
 
 		 385 aa  89.7  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25.27 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 408 aa  87.4  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  23.04 
 
 		 385 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  22.4 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 		 402 aa  86.7  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  24.55 
 
 		 369 aa  86.7  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  24.45 
 
 		 380 aa  86.3  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  23.81 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  24.38 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  23.69 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  23.1 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  26.03 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  23.9 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  23.96 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  24.18 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  23.6 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  23.03 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  21.91 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  22.53 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08531  dehydrogenases (flavoproteins)  24.84 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.741714  hitchhiker  0.00186449 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0269  geranylgeranyl reductase  22.99 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0349456 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  23.46 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  24.38 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  23.68 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  23.96 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  24.7 
 
 		 387 aa  72.8  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  24.86 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  24.01 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  23.45 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2805  monooxygenase FAD-binding protein  24.54 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  24.48 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  26.33 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  23.03 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  23.98 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  24.03 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  24.38 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  22.37 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  23.99 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  23.66 
 
 		 452 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0732  hypothetical protein  27.33 
 
 		 358 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  25.15 
 
 		 452 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1405  monooxygenase FAD-binding  23.97 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.144812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  21.47 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  21.93 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  23.58 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  24.2 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  20.89 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  22.98 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  23.41 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  21.58 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  23.19 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  21.51 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  21.17 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.25 
 
 		 468 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  23.19 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.12 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1429  hypothetical protein  22.89 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0716636 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  22.99 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1653  FAD-binding monooxygenase  23.97 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  22.02 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0893  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  24.01 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  24.68 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  22.65 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  22.91 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  22.54 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.82 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  21.67 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  21.48 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  21.61 
 
 		 457 aa  59.7  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  23.42 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0114  FAD dependent oxidoreductase  23.51 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00154267  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  23.16 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  25.37 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  25.29 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2063  hypothetical protein  25.13 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  21.39 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  24.75 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  23.22 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  27.35 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  20.05 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  24.05 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>