244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1653 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1653  FAD-binding monooxygenase  100 
 
 		 404 aa  815    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1405  monooxygenase FAD-binding  66.39 
 
 		 368 aa  461  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.144812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2805  monooxygenase FAD-binding protein  32.35 
 
 		 369 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5207  monooxygenase, FAD-binding protein  32.69 
 
 		 379 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00824524  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  22.46 
 
 		 390 aa  94  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  27.7 
 
 		 399 aa  92.8  9e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  22.31 
 
 		 390 aa  90.9  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  22.61 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  27.33 
 
 		 396 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  22.32 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  22.42 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  29.13 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  24.76 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  22.19 
 
 		 396 aa  79.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  19.95 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  24.1 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  26.71 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  24.3 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  29.54 
 
 		 375 aa  76.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  29.84 
 
 		 365 aa  75.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  20.89 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  24.77 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  22.54 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  20 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  22.98 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  26.67 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  21.98 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  23.97 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  24.11 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  25.33 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  25.33 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  24.1 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  23.75 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  22.47 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  23.36 
 
 		 380 aa  66.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  29.25 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  27.04 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  23.68 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  28.48 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  25.08 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  24.37 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  23.97 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  22.48 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  27.97 
 
 		 445 aa  63.2  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  27.87 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  27.91 
 
 		 393 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  24.81 
 
 		 394 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  20.33 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  25.92 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  26.77 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0166  geranylgeranyl reductase  24.15 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  23.11 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  20.73 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  27.21 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  25.79 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  23.56 
 
 		 380 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1429  hypothetical protein  26.08 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0716636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  26.58 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  24.65 
 
 		 453 aa  59.7  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  25.87 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.412484 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  24.76 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  22.53 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  27.05 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  28.38 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  29.34 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  27.86 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  26.16 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  25.89 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  27.16 
 
 		 384 aa  57  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  32.14 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  26.81 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  25.75 
 
 		 430 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 		 432 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  26.9 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  25.71 
 
 		 434 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  26.39 
 
 		 362 aa  54.7  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  26.56 
 
 		 426 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0590  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.83 
 
 		 407 aa  54.3  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00186747  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 		 382 aa  53.9  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 376 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  25.14 
 
 		 452 aa  53.9  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  25.94 
 
 		 398 aa  53.9  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  21.9 
 
 		 379 aa  53.5  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  27.35 
 
 		 360 aa  53.5  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  22.02 
 
 		 374 aa  53.5  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  29.13 
 
 		 376 aa  53.5  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1156  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  20.54 
 
 		 388 aa  53.5  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  26.7 
 
 		 392 aa  53.1  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  25.66 
 
 		 375 aa  53.1  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  26.01 
 
 		 394 aa  53.1  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  26.27 
 
 		 430 aa  53.1  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2544  geranylgeranyl reductase family protein  36.13 
 
 		 353 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4514  monooxygenase FAD-binding  31.49 
 
 		 508 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2172  geranylgeranyl reductase  36.13 
 
 		 353 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.328813  decreased coverage  0.000000000712182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  24.77 
 
 		 515 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  25.68 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  23.29 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  28.57 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>