113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0732 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0732  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  723    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2291  hypothetical protein  67.88 
 
 		 358 aa  506  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0761399 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1933  hypothetical protein  69.83 
 
 		 358 aa  485  1e-136  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2063  hypothetical protein  64.69 
 
 		 363 aa  429  1e-119  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0893  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  30.22 
 
 		 393 aa  139  7e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0783  monooxygenase, FAD-binding  31.02 
 
 		 375 aa  110  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  24.67 
 
 		 392 aa  89  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  26.43 
 
 		 392 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  27.85 
 
 		 382 aa  87  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  26.06 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  29.15 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  26.45 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  25.56 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  25.79 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  26.77 
 
 		 388 aa  75.9  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  29.64 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  28.33 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  25.7 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  25.85 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  25.99 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  27.33 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  24.36 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0269  geranylgeranyl reductase  26.71 
 
 		 361 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0349456 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  24.11 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  25.25 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 385 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  24.28 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  23.66 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  25.24 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  24.5 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  25.46 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0160  FAD dependent oxidoreductase  25.91 
 
 		 332 aa  57  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  23.82 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  23.12 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  24.57 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  23.26 
 
 		 394 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  24.36 
 
 		 405 aa  54.3  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  23.26 
 
 		 394 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4237  putative oxidoreductase  22.19 
 
 		 356 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.48 
 
 		 446 aa  53.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1405  monooxygenase FAD-binding  25.71 
 
 		 368 aa  53.1  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.144812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  25.79 
 
 		 452 aa  52.8  0.000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  21.76 
 
 		 380 aa  52.8  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6424  geranylgeranyl reductase  32.14 
 
 		 403 aa  52.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  25.41 
 
 		 400 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  24.07 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  22.51 
 
 		 457 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  23.65 
 
 		 365 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.48 
 
 		 446 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  23.23 
 
 		 394 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  22.87 
 
 		 449 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1774  FAD dependent oxidoreductase  30.85 
 
 		 369 aa  50.8  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.496071 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  23.72 
 
 		 407 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  27.61 
 
 		 402 aa  50.4  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  40.28 
 
 		 390 aa  50.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  22.96 
 
 		 455 aa  50.1  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  26.02 
 
 		 398 aa  50.1  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 369 aa  49.7  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  20.81 
 
 		 391 aa  49.3  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  26.45 
 
 		 399 aa  49.7  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  24.7 
 
 		 443 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  25.61 
 
 		 341 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.7 
 
 		 443 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  25.86 
 
 		 375 aa  48.9  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  24.45 
 
 		 405 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  24.05 
 
 		 380 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.39 
 
 		 445 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  40 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  21.9 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  24.28 
 
 		 405 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  38.57 
 
 		 390 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  24.28 
 
 		 405 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  22.87 
 
 		 446 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  22.96 
 
 		 406 aa  46.6  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11161  oxidoreductase  48 
 
 		 338 aa  47  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.264314 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  47.62 
 
 		 374 aa  46.6  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  22.08 
 
 		 405 aa  46.6  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0454  ubiquinone biosynthesis hydroxylase family protein  42.65 
 
 		 392 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0640932 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  21.67 
 
 		 396 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1604  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 391 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  24.75 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5207  monooxygenase, FAD-binding protein  26.74 
 
 		 379 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00824524  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  22.09 
 
 		 468 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5367  geranylgeranyl reductase  25.18 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.707854 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2949  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  23.55 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  37.5 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5158  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  26.16 
 
 		 671 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0654699  normal  0.0882409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5951  monooxygenase FAD-binding protein  43.86 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  36 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  24.34 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10918  putative oxidoreductase  32.65 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.183929  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  22.87 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  33.78 
 
 		 404 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0114  FAD dependent oxidoreductase  23.14 
 
 		 399 aa  44.3  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00154267  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119498  geranylgeranyl reductase  45.61 
 
 		 462 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  23.12 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5289  geranylgeranyl reductase  24.34 
 
 		 397 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1653  FAD-binding monooxygenase  26.98 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>