199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1405 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1405  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 368 aa  744    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.144812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1653  FAD-binding monooxygenase  66.39 
 
 		 404 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5207  monooxygenase, FAD-binding protein  32.01 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00824524  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2805  monooxygenase FAD-binding protein  30.61 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  22.83 
 
 		 379 aa  86.3  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  22.43 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  21.1 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  24.62 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  22.77 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  22.83 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  23.03 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  22.02 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  25.86 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  19.73 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  24.92 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  25.61 
 
 		 396 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  25.19 
 
 		 376 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  22.02 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  23.06 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  21.2 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  23.78 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  22.16 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  26.26 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  25.56 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  26.75 
 
 		 360 aa  69.3  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  26.21 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  26.72 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  24.13 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  27.71 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  29.32 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  23.66 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  27.54 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  23.73 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  24.75 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  28.08 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  23.37 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6424  geranylgeranyl reductase  29.03 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  24.06 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  20.83 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  21.53 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  20 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  25.82 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  26.99 
 
 		 378 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  23.55 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  24.63 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  25.15 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  27.5 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  25.69 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  25.22 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0114  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00154267  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  23.42 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  26.8 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0269  geranylgeranyl reductase  27.05 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0349456 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  25.75 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2291  hypothetical protein  30.06 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0761399 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  24.78 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  25.46 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  30.37 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0732  hypothetical protein  25.82 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  26.03 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0166  geranylgeranyl reductase  23.46 
 
 		 453 aa  56.2  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  25.57 
 
 		 425 aa  56.2  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  22.77 
 
 		 394 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  26.1 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 		 385 aa  55.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3860  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 		 438 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00230775  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  22.77 
 
 		 394 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  26.16 
 
 		 424 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  24.85 
 
 		 393 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  24.44 
 
 		 396 aa  54.7  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  26.01 
 
 		 475 aa  53.9  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  28.31 
 
 		 394 aa  53.5  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  26.38 
 
 		 409 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  26.44 
 
 		 375 aa  53.5  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  21.23 
 
 		 377 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  26.96 
 
 		 369 aa  53.5  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  25.99 
 
 		 418 aa  53.1  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  25.95 
 
 		 365 aa  53.1  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0590  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.83 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00186747  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2832  flavoprotein  29.33 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1463  hypothetical protein  29.33 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261664  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  29.53 
 
 		 396 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  25.62 
 
 		 407 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  22.99 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  25.75 
 
 		 488 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  24.54 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  25.63 
 
 		 445 aa  51.2  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2315  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  21.08 
 
 		 436 aa  50.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0377746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  22.11 
 
 		 362 aa  50.4  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  20.41 
 
 		 382 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  28.4 
 
 		 382 aa  50.4  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  23.66 
 
 		 374 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  24.61 
 
 		 515 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  23.62 
 
 		 375 aa  50.1  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  25.09 
 
 		 382 aa  49.7  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  27.39 
 
 		 388 aa  50.1  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  24.01 
 
 		 432 aa  49.7  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2099  hypothetical protein  27.36 
 
 		 396 aa  49.7  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5367  geranylgeranyl reductase  24.66 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.707854 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>