179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5207 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5207  monooxygenase, FAD-binding protein  100 
 
 
379 aa  730    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00824524  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2805  monooxygenase FAD-binding protein  60.76 
 
 
369 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1653  FAD-binding monooxygenase  32.24 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1405  monooxygenase FAD-binding  32.01 
 
 
368 aa  95.9  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.144812  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  28.36 
 
 
387 aa  89.4  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  28.53 
 
 
382 aa  86.7  6e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  23.44 
 
 
402 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  24.26 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  30.24 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  26.76 
 
 
396 aa  76.3  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  21.88 
 
 
392 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  25.7 
 
 
382 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  22.52 
 
 
408 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  21.45 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  25.24 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  28.45 
 
 
401 aa  69.7  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  26.6 
 
 
391 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  25.3 
 
 
390 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  32.97 
 
 
388 aa  68.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  25 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  24.53 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  28.04 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  24.41 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  25.55 
 
 
386 aa  67  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  22.12 
 
 
392 aa  67  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  24.54 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  30.07 
 
 
394 aa  66.6  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  30.23 
 
 
384 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  23.15 
 
 
390 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  28.21 
 
 
394 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  28.21 
 
 
394 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  22.46 
 
 
386 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  22.19 
 
 
385 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  23.26 
 
 
379 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  25.08 
 
 
390 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  30.31 
 
 
365 aa  64.7  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  31.32 
 
 
384 aa  63.9  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  21.27 
 
 
396 aa  63.5  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.24 
 
 
389 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  29.07 
 
 
375 aa  62.8  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  27.78 
 
 
360 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  22.16 
 
 
378 aa  61.6  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  25.67 
 
 
391 aa  61.6  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  23.4 
 
 
391 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  25.55 
 
 
407 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6424  geranylgeranyl reductase  28.9 
 
 
403 aa  60.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  28.85 
 
 
384 aa  60.1  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  28.01 
 
 
405 aa  60.1  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  24.21 
 
 
393 aa  59.7  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  25.83 
 
 
399 aa  59.7  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  27.9 
 
 
401 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  28.06 
 
 
385 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  29.05 
 
 
398 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  23.08 
 
 
396 aa  58.2  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  26.04 
 
 
380 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  28.83 
 
 
400 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  26.27 
 
 
363 aa  57.4  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  30.19 
 
 
402 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  27.71 
 
 
373 aa  57  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  30.94 
 
 
400 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  28.24 
 
 
403 aa  57  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10571  oxidoreductase  29.96 
 
 
408 aa  57  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649109  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  26.47 
 
 
380 aa  56.6  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0991  geranylgeranyl reductase  30.69 
 
 
418 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0431  hypothetical protein  25.86 
 
 
422 aa  56.2  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.446535  normal  0.169558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  28.32 
 
 
398 aa  56.6  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  27.44 
 
 
380 aa  55.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  25.37 
 
 
398 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5254  geranylgeranyl reductase  29.09 
 
 
416 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  27.65 
 
 
379 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4239  monooxygenase FAD-binding  30.94 
 
 
407 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25.98 
 
 
379 aa  54.7  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  24.87 
 
 
418 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  24.48 
 
 
380 aa  53.9  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1099  geranylgeranyl reductase  30.58 
 
 
435 aa  54.3  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.997696  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  22.6 
 
 
384 aa  54.3  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  26.39 
 
 
380 aa  53.5  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  22.25 
 
 
379 aa  53.5  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  26.19 
 
 
423 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  29.54 
 
 
424 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  24.75 
 
 
406 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2779  geranylgeranyl reductase  31.25 
 
 
330 aa  52.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2256  FAD-binding monooxygenase  30.12 
 
 
399 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.75 
 
 
449 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  28.86 
 
 
400 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  25.66 
 
 
406 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  28.86 
 
 
406 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  28.86 
 
 
406 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  25.52 
 
 
406 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  26.78 
 
 
381 aa  51.6  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  27.2 
 
 
413 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.04 
 
 
468 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 
418 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4822  geranylgeranyl reductase  29.29 
 
 
397 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.0333239 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  30.59 
 
 
341 aa  50.4  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0167  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 
393 aa  50.4  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  29.02 
 
 
368 aa  50.4  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  31.33 
 
 
376 aa  50.4  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  26.18 
 
 
398 aa  50.1  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  27.76 
 
 
411 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>