164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0431 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0431  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  854    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.446535  normal  0.169558 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4688  monooxygenase FAD-binding  42.49 
 
 		 417 aa  319  7e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08531  dehydrogenases (flavoproteins)  32.75 
 
 		 398 aa  211  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.741714  hitchhiker  0.00186449 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1429  hypothetical protein  35.27 
 
 		 395 aa  196  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0716636 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15361  NAD binding site  32.84 
 
 		 405 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.298365 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1070  hypothetical protein  31.36 
 
 		 387 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 		 410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 411 aa  120  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 		 410 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  30.79 
 
 		 405 aa  120  6e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 414 aa  108  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 413 aa  102  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  29.14 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  26.52 
 
 		 418 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  26.37 
 
 		 425 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  28.22 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  23.6 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  23.14 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  24.3 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  25.96 
 
 		 452 aa  71.2  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  23.63 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  27.58 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  23.36 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  29.51 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 		 378 aa  67  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  23.54 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  22.19 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  24.02 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  24.5 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  22.35 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  26.36 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  26.3 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  23.12 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  21.19 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  22.56 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  27.56 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  24.74 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  25.06 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  26.74 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  22.93 
 
 		 457 aa  62  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  22.11 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  26.97 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  25.75 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.21 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  22.83 
 
 		 386 aa  59.7  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  27.22 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  26.51 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  21.82 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  23.39 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  25.72 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  26.93 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  27.11 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  25.59 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  22.34 
 
 		 380 aa  57  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  21.78 
 
 		 408 aa  57  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  23.8 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  21.76 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  22.01 
 
 		 468 aa  56.6  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05221  NAD binding site  25.1 
 
 		 375 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  24.62 
 
 		 444 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  22.75 
 
 		 452 aa  55.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  21.76 
 
 		 446 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  24.71 
 
 		 375 aa  55.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  27.86 
 
 		 425 aa  55.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  22.07 
 
 		 446 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5207  monooxygenase, FAD-binding protein  24.78 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00824524  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  25.97 
 
 		 443 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  23.33 
 
 		 458 aa  54.3  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  23.59 
 
 		 380 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25.07 
 
 		 449 aa  54.3  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  20.7 
 
 		 405 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  23.85 
 
 		 406 aa  53.9  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0520  NAD binding site  23.5 
 
 		 377 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  20.7 
 
 		 405 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  21.27 
 
 		 455 aa  53.5  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  25.89 
 
 		 426 aa  53.5  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  25.33 
 
 		 411 aa  53.5  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  21.28 
 
 		 395 aa  53.5  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  21.18 
 
 		 393 aa  53.1  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  21.59 
 
 		 379 aa  53.1  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  23.11 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  21.2 
 
 		 445 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.11 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43800  predicted protein  28.65 
 
 		 528 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  21.07 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  21.74 
 
 		 449 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  22.22 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  25.69 
 
 		 341 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2805  monooxygenase FAD-binding protein  29.1 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  23.5 
 
 		 390 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  22.94 
 
 		 380 aa  51.2  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10571  oxidoreductase  29.89 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649109  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  24.67 
 
 		 443 aa  51.2  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  23.41 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  24.08 
 
 		 374 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  20.11 
 
 		 377 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  25.85 
 
 		 430 aa  50.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  29.91 
 
 		 415 aa  50.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  23.01 
 
 		 382 aa  50.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>