More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2299 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 374 aa  769    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  64.42 
 
 		 373 aa  498  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  62.5 
 
 		 373 aa  484  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  59.84 
 
 		 368 aa  482  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  58.31 
 
 		 370 aa  456  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  54.67 
 
 		 376 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  51.87 
 
 		 376 aa  398  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0709  geranylgeranyl reductase  38.69 
 
 		 377 aa  261  1e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  35.95 
 
 		 376 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05221  NAD binding site  35.97 
 
 		 375 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  35.14 
 
 		 376 aa  249  7e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07601  NAD binding site  36.42 
 
 		 375 aa  249  7e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1650  geranylgeranyl reductase  36.44 
 
 		 381 aa  244  3e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  34.23 
 
 		 377 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  33.78 
 
 		 377 aa  239  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  33.24 
 
 		 377 aa  239  8e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0520  NAD binding site  33.24 
 
 		 377 aa  236  6e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  30.67 
 
 		 378 aa  159  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  30.95 
 
 		 387 aa  146  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  30.43 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  31.61 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  27.51 
 
 		 382 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  28.35 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  27.88 
 
 		 374 aa  123  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1604  geranylgeranyl reductase  29.39 
 
 		 391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  27.91 
 
 		 384 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  29.71 
 
 		 382 aa  119  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  30.62 
 
 		 384 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  30.47 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  27.25 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  26.9 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  26.8 
 
 		 385 aa  112  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  26.83 
 
 		 389 aa  109  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  28.12 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  29.79 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  27.53 
 
 		 403 aa  104  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2391  geranylgeranyl reductase  28.84 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  30.02 
 
 		 424 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  32.53 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  27.84 
 
 		 380 aa  97.8  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  30.51 
 
 		 367 aa  97.4  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  27.98 
 
 		 380 aa  96.7  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  28.03 
 
 		 383 aa  96.3  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  26.91 
 
 		 401 aa  95.9  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  29.77 
 
 		 362 aa  95.1  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  27.46 
 
 		 394 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  27.46 
 
 		 394 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  30.43 
 
 		 394 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  27.88 
 
 		 434 aa  94  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  27.99 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  28.21 
 
 		 398 aa  91.3  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  30.1 
 
 		 358 aa  90.5  5e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  28.12 
 
 		 400 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  26.25 
 
 		 380 aa  89.4  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  25.57 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  26.59 
 
 		 394 aa  89  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  25.22 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  27.33 
 
 		 384 aa  89  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  27.82 
 
 		 455 aa  88.2  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  27.91 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  28.79 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  27.81 
 
 		 379 aa  87.4  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  25.66 
 
 		 390 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27 
 
 		 446 aa  86.7  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  26.44 
 
 		 390 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  26.4 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  25.6 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  27.12 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  27.08 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  25.15 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  26.93 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  28.33 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  26.76 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  26.35 
 
 		 425 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  28.86 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  26.61 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  27.5 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  25.66 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.95 
 
 		 449 aa  82.8  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  25.16 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  25.61 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  23.82 
 
 		 441 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  23.35 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  27.85 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  24.88 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  25.12 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  26.05 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  27.12 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  27.86 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  26.27 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  24.33 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  28.12 
 
 		 431 aa  79.7  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  27.06 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  24.78 
 
 		 374 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  26.78 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  27.47 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  26.05 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0431  hypothetical protein  25.59 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.446535  normal  0.169558 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.14 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  25.6 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>