More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1193 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 362 aa  733    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  39.58 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  39.72 
 
 		 358 aa  175  9e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  38.46 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  39.22 
 
 		 358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  33.81 
 
 		 375 aa  145  9e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  32.09 
 
 		 378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  28.46 
 
 		 370 aa  132  9e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  29.23 
 
 		 387 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  33.56 
 
 		 379 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  26.96 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  27.58 
 
 		 377 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  30.75 
 
 		 384 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  28.9 
 
 		 376 aa  117  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  25.52 
 
 		 368 aa  116  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  32.41 
 
 		 384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  29.09 
 
 		 374 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  26.82 
 
 		 377 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  30.11 
 
 		 368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  29.37 
 
 		 373 aa  110  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  28.08 
 
 		 373 aa  109  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  25.97 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  30.57 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.38 
 
 		 389 aa  106  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  30.82 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  25.5 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  26.75 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  30.07 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  29.06 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  26.99 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  30.92 
 
 		 409 aa  99.8  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  27 
 
 		 393 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2391  geranylgeranyl reductase  32.04 
 
 		 375 aa  97.1  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0709  geranylgeranyl reductase  26.28 
 
 		 377 aa  96.7  5e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  27.25 
 
 		 374 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  28.4 
 
 		 394 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0520  NAD binding site  25.45 
 
 		 377 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  28.4 
 
 		 394 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  28.61 
 
 		 384 aa  94  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 421 aa  93.6  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  29.52 
 
 		 413 aa  93.2  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  28.4 
 
 		 423 aa  93.2  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  28.75 
 
 		 403 aa  92.4  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  27.63 
 
 		 380 aa  92.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  31.82 
 
 		 409 aa  92  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  28.41 
 
 		 401 aa  91.3  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  25.27 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07601  NAD binding site  25.75 
 
 		 375 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  30.15 
 
 		 430 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  32.75 
 
 		 402 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05221  NAD binding site  26.29 
 
 		 375 aa  90.1  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  27.6 
 
 		 394 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  28.31 
 
 		 457 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  26.32 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25.44 
 
 		 379 aa  88.6  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  25.94 
 
 		 380 aa  87.8  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  26.49 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  28.7 
 
 		 423 aa  87  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  27.38 
 
 		 435 aa  86.7  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  26.48 
 
 		 425 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  32.13 
 
 		 403 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1604  geranylgeranyl reductase  32.78 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  25.57 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  29.65 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0327  geranylgeranyl reductase  32.34 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.252383  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  29.09 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  31.68 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  28.96 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  23.84 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  28.03 
 
 		 414 aa  82.8  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  26.87 
 
 		 406 aa  82.8  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  27.55 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  25.67 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  30 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  25.77 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  26.98 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  28.18 
 
 		 431 aa  81.6  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  24.62 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  28.3 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  26.59 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  26.4 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1650  geranylgeranyl reductase  25.2 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0114  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00154267  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  26.34 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  26.2 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  28.83 
 
 		 398 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  27.62 
 
 		 457 aa  79.7  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  27.98 
 
 		 400 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  29.65 
 
 		 400 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  25.3 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  24 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  26.23 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  25.9 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  30.36 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.9 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  26.01 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  30.82 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  25.69 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  26.75 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>