282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_16731 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  79.37 
 
 		 446 aa  746    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  79.14 
 
 		 443 aa  682    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  77.09 
 
 		 452 aa  712    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  78.77 
 
 		 455 aa  709    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  81.61 
 
 		 446 aa  758    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  82.66 
 
 		 449 aa  746    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  79.37 
 
 		 446 aa  747    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  77.35 
 
 		 445 aa  705    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  79.14 
 
 		 443 aa  682    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  100 
 
 		 468 aa  968    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  71.92 
 
 		 405 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  71.92 
 
 		 405 aa  614  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  69.45 
 
 		 457 aa  612  9.999999999999999e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  71.6 
 
 		 406 aa  608  1e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  69.95 
 
 		 405 aa  605  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  71.85 
 
 		 406 aa  605  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  71.11 
 
 		 418 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  69.88 
 
 		 407 aa  594  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119498  geranylgeranyl reductase  65.84 
 
 		 462 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50650  predicted protein  62.1 
 
 		 463 aa  498  1e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  41.06 
 
 		 421 aa  310  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  40.58 
 
 		 406 aa  299  9e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  43.1 
 
 		 379 aa  297  3e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  40.58 
 
 		 406 aa  296  7e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  41.87 
 
 		 379 aa  286  8e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  40.79 
 
 		 380 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  41.23 
 
 		 380 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  39.75 
 
 		 380 aa  265  8.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  39.26 
 
 		 380 aa  265  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  40.49 
 
 		 380 aa  262  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  40 
 
 		 394 aa  240  4e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  38.44 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  38.44 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  39.55 
 
 		 400 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  38.29 
 
 		 400 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  38.67 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  37.11 
 
 		 400 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  37.6 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0167  geranylgeranyl reductase  36.36 
 
 		 393 aa  220  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  35.87 
 
 		 405 aa  212  9e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  33.51 
 
 		 402 aa  208  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5367  geranylgeranyl reductase  34.83 
 
 		 397 aa  207  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.707854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6424  geranylgeranyl reductase  33.76 
 
 		 403 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4822  geranylgeranyl reductase  35.17 
 
 		 397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.0333239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5289  geranylgeranyl reductase  35.17 
 
 		 397 aa  201  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2063  geranylgeranyl reductase  34.6 
 
 		 399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104109 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  31.82 
 
 		 408 aa  194  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2779  geranylgeranyl reductase  31.94 
 
 		 330 aa  169  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0629  geranylgeranyl reductase  32.9 
 
 		 413 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978932  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  29.11 
 
 		 375 aa  106  8e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  26.33 
 
 		 387 aa  99.8  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  28.83 
 
 		 378 aa  100  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 381 aa  95.1  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  26.61 
 
 		 418 aa  90.5  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  28.9 
 
 		 382 aa  89.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  26.63 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  28 
 
 		 424 aa  88.2  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  27.76 
 
 		 390 aa  86.7  8e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  28.02 
 
 		 374 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  25.29 
 
 		 391 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  26.65 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  25.82 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  26.7 
 
 		 431 aa  84  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.65 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  25.93 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  26.74 
 
 		 435 aa  83.6  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  23.1 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25.84 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  25.77 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  27.42 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  26.23 
 
 		 375 aa  79.7  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  25.78 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  23.81 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  27.62 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  27.01 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  25.62 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  26.24 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  25.39 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  34.02 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  23.13 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  24.16 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  27.85 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  26.98 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  24.56 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  26.14 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  26.72 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  23.23 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  29.32 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  24.79 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  27.39 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  28.96 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  26.18 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  26.92 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  27.04 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  25.15 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  28.25 
 
 		 403 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  23.32 
 
 		 370 aa  67  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>