More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2279 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 413 aa  801    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  40.72 
 
 		 423 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  38.78 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  37.66 
 
 		 457 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  35.36 
 
 		 411 aa  177  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  35.92 
 
 		 393 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  37.31 
 
 		 393 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  35.61 
 
 		 425 aa  163  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  36.49 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  34.2 
 
 		 423 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  35.33 
 
 		 418 aa  159  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  37.75 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  38.07 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  39.33 
 
 		 430 aa  153  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  36.56 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  35.31 
 
 		 398 aa  151  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  35.96 
 
 		 414 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  34.82 
 
 		 445 aa  150  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0164  putative electron transfer oxidoreductase  37.76 
 
 		 420 aa  150  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  36.31 
 
 		 430 aa  150  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  35.22 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  35.73 
 
 		 409 aa  145  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  32.99 
 
 		 426 aa  145  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  35.26 
 
 		 424 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  36.18 
 
 		 431 aa  144  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  33.82 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  37.54 
 
 		 393 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  37.54 
 
 		 393 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  37.54 
 
 		 393 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  36.94 
 
 		 419 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  30.79 
 
 		 384 aa  140  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  38.31 
 
 		 440 aa  139  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  32.87 
 
 		 443 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  32.46 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  29.91 
 
 		 376 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  35.73 
 
 		 443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  34.44 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10571  oxidoreductase  34.85 
 
 		 408 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649109  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  35.35 
 
 		 420 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5254  geranylgeranyl reductase  34.44 
 
 		 416 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0808  geranylgeranyl reductase  36.1 
 
 		 406 aa  126  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  hitchhiker  0.000310699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0991  geranylgeranyl reductase  33.53 
 
 		 418 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  33.42 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  34.6 
 
 		 431 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  33.54 
 
 		 406 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0862  geranylgeranyl reductase  36.81 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  31.15 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  35.25 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  33.89 
 
 		 424 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  35.25 
 
 		 400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  33.87 
 
 		 375 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  33.15 
 
 		 403 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1099  geranylgeranyl reductase  37.42 
 
 		 435 aa  113  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.997696  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  29.31 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  28.11 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  27.39 
 
 		 390 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  32.35 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  30.21 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  28.65 
 
 		 390 aa  106  6e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  26.36 
 
 		 415 aa  106  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0327  geranylgeranyl reductase  38.69 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.252383  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  34.46 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0948  geranylgeranyl reductase  35.82 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  30.32 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  32.93 
 
 		 415 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  27.66 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  31.77 
 
 		 400 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  26.57 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  32.92 
 
 		 423 aa  100  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  30.32 
 
 		 379 aa  100  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 		 408 aa  99  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  27.81 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  28 
 
 		 387 aa  97.8  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  25.42 
 
 		 409 aa  96.3  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  30.75 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  27.05 
 
 		 444 aa  94  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  28.73 
 
 		 367 aa  94  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  23.88 
 
 		 370 aa  94  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  26.88 
 
 		 395 aa  93.2  7e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  29.52 
 
 		 362 aa  93.2  8e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  27.45 
 
 		 396 aa  92.8  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  26.19 
 
 		 376 aa  92.8  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18731  NAD binding site  31.62 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.413657 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  34.26 
 
 		 429 aa  92  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0709  geranylgeranyl reductase  29.73 
 
 		 377 aa  90.5  5e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  30.99 
 
 		 401 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  29.17 
 
 		 376 aa  90.1  7e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25.48 
 
 		 379 aa  89.7  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17730  geranylgeranyl reductase family protein  30.21 
 
 		 466 aa  89  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  28.3 
 
 		 358 aa  89.4  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  31.92 
 
 		 368 aa  89  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  30.33 
 
 		 362 aa  89.4  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1512  FAD dependent oxidoreductase  25.28 
 
 		 365 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.193117  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  23.46 
 
 		 375 aa  87.4  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  26.69 
 
 		 453 aa  87.8  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  26.63 
 
 		 373 aa  87  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  31.3 
 
 		 384 aa  86.3  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 		 374 aa  86.3  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  29.06 
 
 		 495 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>