More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1330 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 376 aa  759    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  32.96 
 
 		 375 aa  156  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  30.33 
 
 		 370 aa  153  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  29.94 
 
 		 384 aa  150  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  30.19 
 
 		 378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  29.33 
 
 		 368 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  28.34 
 
 		 389 aa  135  8e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  31.32 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  27.37 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  30.27 
 
 		 373 aa  132  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  28.9 
 
 		 362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  30.89 
 
 		 373 aa  132  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  30.16 
 
 		 376 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  26.54 
 
 		 403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  28.35 
 
 		 374 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  32.06 
 
 		 401 aa  126  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  29.33 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  26.3 
 
 		 385 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  29.87 
 
 		 384 aa  124  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  27.78 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  27.75 
 
 		 377 aa  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  28.24 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  27.82 
 
 		 376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  27.53 
 
 		 377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  26.48 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  24.73 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  27.81 
 
 		 382 aa  109  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  30.25 
 
 		 398 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  24.54 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  30.23 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  26.19 
 
 		 413 aa  105  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  28.05 
 
 		 383 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  28.85 
 
 		 409 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  26.58 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  27.95 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  31.67 
 
 		 379 aa  100  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0709  geranylgeranyl reductase  26.46 
 
 		 377 aa  99.8  7e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0520  NAD binding site  26.6 
 
 		 377 aa  99.4  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  29.63 
 
 		 424 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  29.81 
 
 		 394 aa  97.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  29.81 
 
 		 394 aa  97.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07601  NAD binding site  26.94 
 
 		 375 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  29.43 
 
 		 457 aa  96.3  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1604  geranylgeranyl reductase  26.98 
 
 		 391 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2391  geranylgeranyl reductase  27.53 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  28.42 
 
 		 362 aa  95.1  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  25.77 
 
 		 393 aa  94  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  26.71 
 
 		 393 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  28.79 
 
 		 418 aa  92.8  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  27.74 
 
 		 434 aa  92.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  28.38 
 
 		 394 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  27.24 
 
 		 374 aa  92  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  28.2 
 
 		 434 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.09 
 
 		 376 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  29.14 
 
 		 425 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  25.87 
 
 		 430 aa  90.5  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  31.54 
 
 		 341 aa  90.5  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 		 421 aa  89.7  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  27.54 
 
 		 423 aa  89.7  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  29.45 
 
 		 400 aa  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  30.07 
 
 		 348 aa  89.4  9e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  23.88 
 
 		 384 aa  89.4  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  27.07 
 
 		 409 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  27.11 
 
 		 358 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0269  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0349456 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  27.54 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  26.42 
 
 		 367 aa  87.8  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  27.74 
 
 		 390 aa  87.4  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  28.45 
 
 		 426 aa  87  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05221  NAD binding site  27.03 
 
 		 375 aa  86.7  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  26.91 
 
 		 361 aa  86.7  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  31.23 
 
 		 380 aa  86.3  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  30.79 
 
 		 380 aa  86.3  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  29.22 
 
 		 379 aa  86.3  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  26.86 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  28.92 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  26.44 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  27.21 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  27.01 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  27.22 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  25.44 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  27 
 
 		 431 aa  84  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  31.27 
 
 		 380 aa  82.8  0.000000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  31.8 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  28.65 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  27.37 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  26.9 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  26.01 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  26.9 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  26.5 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  28.36 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  26.06 
 
 		 396 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  27.62 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  31.8 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  27.81 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  27.08 
 
 		 390 aa  79.3  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2063  geranylgeranyl reductase  29.24 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0327  geranylgeranyl reductase  27.4 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.252383  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  25.29 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  26.69 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>