261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_07961 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 443 aa  908    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  76.3 
 
 		 452 aa  680    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  75.11 
 
 		 455 aa  677    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  80.91 
 
 		 446 aa  741    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  84.32 
 
 		 449 aa  746    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  80.91 
 
 		 446 aa  744    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  96.84 
 
 		 445 aa  858    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  100 
 
 		 443 aa  908    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  79.14 
 
 		 468 aa  733    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  80.91 
 
 		 446 aa  744    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  72.2 
 
 		 405 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  72.2 
 
 		 405 aa  619  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  70.81 
 
 		 457 aa  620  1e-176  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  70.98 
 
 		 405 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  71.64 
 
 		 406 aa  613  9.999999999999999e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  71.15 
 
 		 418 aa  610  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  70.9 
 
 		 406 aa  602  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  69.42 
 
 		 407 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119498  geranylgeranyl reductase  64.3 
 
 		 462 aa  506  9.999999999999999e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50650  predicted protein  61.41 
 
 		 463 aa  483  1e-135  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  41.54 
 
 		 421 aa  310  4e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  40.9 
 
 		 406 aa  303  6.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  40.4 
 
 		 406 aa  299  8e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  41.34 
 
 		 379 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  40.73 
 
 		 380 aa  259  7e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  39.85 
 
 		 379 aa  256  6e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  39.7 
 
 		 380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  39.21 
 
 		 380 aa  251  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  39.02 
 
 		 380 aa  247  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  39.27 
 
 		 380 aa  242  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  38.31 
 
 		 400 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  38.66 
 
 		 394 aa  237  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  36.66 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  36.32 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0167  geranylgeranyl reductase  35.86 
 
 		 393 aa  223  6e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  34.79 
 
 		 394 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  34.79 
 
 		 394 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  37.08 
 
 		 401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  35.56 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6424  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  33.84 
 
 		 405 aa  211  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5367  geranylgeranyl reductase  35.45 
 
 		 397 aa  210  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.707854 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2063  geranylgeranyl reductase  33.92 
 
 		 399 aa  202  9e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104109 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5289  geranylgeranyl reductase  34.47 
 
 		 397 aa  200  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4822  geranylgeranyl reductase  34.39 
 
 		 397 aa  199  6e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.0333239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  32.01 
 
 		 402 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  32.14 
 
 		 408 aa  196  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2779  geranylgeranyl reductase  33.63 
 
 		 330 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0629  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 		 413 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978932  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  27.02 
 
 		 375 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  28.92 
 
 		 378 aa  110  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  26.5 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  27.08 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  24.69 
 
 		 408 aa  89.7  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  26.79 
 
 		 418 aa  89.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  27.72 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  26.8 
 
 		 396 aa  87  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  28.49 
 
 		 348 aa  87  6e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  26.69 
 
 		 382 aa  86.7  8e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  26.39 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25.51 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  26.59 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  26.04 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  24.71 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  25.81 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  25.97 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  25.07 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  25.47 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  26.57 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  25.42 
 
 		 362 aa  79.3  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  27.36 
 
 		 384 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  27.51 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  27.4 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  24.71 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  25.92 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  24.53 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  27.02 
 
 		 375 aa  76.3  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  26.25 
 
 		 379 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  27.65 
 
 		 390 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  24.63 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  33.64 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  21.59 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  24.03 
 
 		 392 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  26.63 
 
 		 368 aa  73.2  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  25.56 
 
 		 385 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  26.14 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  24.81 
 
 		 430 aa  72  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  29.02 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  27.83 
 
 		 365 aa  71.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  24.38 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  24.74 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  26.62 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  22.91 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  24.3 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  26.36 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  25.98 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  27.44 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  23.05 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>