More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0266 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  100 
 
 
445 aa  886    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  66.67 
 
 
423 aa  569  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  67.8 
 
 
418 aa  568  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  67.13 
 
 
434 aa  566  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  66.18 
 
 
424 aa  560  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  62.36 
 
 
435 aa  553  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  66.18 
 
 
425 aa  550  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  68.99 
 
 
440 aa  541  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  65.31 
 
 
423 aa  529  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  61.96 
 
 
434 aa  530  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  64.35 
 
 
423 aa  521  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  57.54 
 
 
457 aa  486  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  58.63 
 
 
430 aa  481  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  58.17 
 
 
426 aa  475  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  59.29 
 
 
430 aa  460  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  54.82 
 
 
431 aa  458  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  57.38 
 
 
443 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  55.42 
 
 
431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  57.52 
 
 
424 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  53.3 
 
 
431 aa  431  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  54.14 
 
 
443 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  53.18 
 
 
444 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  52.4 
 
 
419 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17730  geranylgeranyl reductase family protein  45.27 
 
 
466 aa  320  1.9999999999999998e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  40.15 
 
 
436 aa  245  9e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5254  geranylgeranyl reductase  39.11 
 
 
416 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  37.26 
 
 
393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  37.26 
 
 
393 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1099  geranylgeranyl reductase  37.77 
 
 
435 aa  189  7e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.997696  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  39.18 
 
 
415 aa  189  9e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  38.74 
 
 
406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  38.74 
 
 
406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  36.5 
 
 
400 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  35.86 
 
 
393 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  35.86 
 
 
393 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  35.86 
 
 
393 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0991  geranylgeranyl reductase  35.4 
 
 
418 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0948  geranylgeranyl reductase  37.18 
 
 
417 aa  179  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10571  oxidoreductase  36.01 
 
 
408 aa  178  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649109  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  35.29 
 
 
413 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  30.67 
 
 
384 aa  149  7e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  33.03 
 
 
398 aa  136  7.000000000000001e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  28.65 
 
 
376 aa  133  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  34.16 
 
 
420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0164  putative electron transfer oxidoreductase  38.21 
 
 
420 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.762503  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  32.84 
 
 
411 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  27.57 
 
 
398 aa  119  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  35.07 
 
 
425 aa  118  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  34.7 
 
 
409 aa  116  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  31.53 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  27.61 
 
 
415 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  35.18 
 
 
429 aa  113  9e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  31.2 
 
 
375 aa  110  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  31.95 
 
 
409 aa  110  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  33.73 
 
 
378 aa  110  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  32.85 
 
 
506 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  29.24 
 
 
408 aa  101  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  27.1 
 
 
455 aa  99.8  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.84 
 
 
389 aa  99.8  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  26.89 
 
 
480 aa  99  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  26.65 
 
 
395 aa  98.6  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  28.03 
 
 
444 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  26.57 
 
 
382 aa  97.8  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  26.56 
 
 
376 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  33.77 
 
 
406 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  28.79 
 
 
385 aa  95.9  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  29.68 
 
 
406 aa  95.1  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  32.04 
 
 
400 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  31.82 
 
 
384 aa  94.7  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  21.74 
 
 
375 aa  94  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  25.41 
 
 
387 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  31.99 
 
 
403 aa  92  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  28.83 
 
 
379 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  26.5 
 
 
390 aa  90.9  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  27.63 
 
 
362 aa  90.9  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  30.75 
 
 
403 aa  90.5  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  28 
 
 
402 aa  89.7  8e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  29.91 
 
 
384 aa  89.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  27.37 
 
 
390 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  25.42 
 
 
444 aa  89  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.08 
 
 
445 aa  87.8  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  30.68 
 
 
376 aa  87.8  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  27.79 
 
 
398 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  26.88 
 
 
439 aa  86.7  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  26.88 
 
 
439 aa  86.7  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  30.99 
 
 
379 aa  86.7  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  27.88 
 
 
396 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  31.07 
 
 
400 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  25.38 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  28.66 
 
 
367 aa  85.5  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  26.61 
 
 
390 aa  85.1  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  28.21 
 
 
379 aa  84.7  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  32.81 
 
 
383 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  26.59 
 
 
368 aa  84.3  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  29.25 
 
 
407 aa  84  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 
438 aa  84  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  26.63 
 
 
387 aa  84  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  32.63 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  32.63 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  27.81 
 
 
495 aa  83.6  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>