More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3481 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 374 aa  775    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0533  geranylgeranyl reductase  31.99 
 
 		 278 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.449269  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  26.77 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  28.71 
 
 		 387 aa  96.7  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  30.87 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  29.28 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  31.58 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  27.78 
 
 		 379 aa  93.2  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  26.75 
 
 		 368 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  29.79 
 
 		 374 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  25.96 
 
 		 384 aa  90.1  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  29.58 
 
 		 384 aa  90.5  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  29.41 
 
 		 385 aa  87.4  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 376 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 		 413 aa  86.3  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  29.09 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  30.58 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  27.16 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  29.77 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  28.85 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  27.78 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.96 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  28.48 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  28.66 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  28.37 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  27.84 
 
 		 431 aa  80.1  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  29.34 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  26.96 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  29.45 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  27.18 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  28.35 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  29.01 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  25.82 
 
 		 431 aa  79  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  26.79 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  28.39 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  27.24 
 
 		 376 aa  79.3  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  26.76 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  25.29 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  29.13 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  26.39 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  30.36 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  28.39 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  29.77 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  26.26 
 
 		 425 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  25 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  27.78 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  28.33 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  29.94 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  26.67 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  27.3 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  26.76 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  26.14 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  27.65 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  27.49 
 
 		 457 aa  74.7  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  27.03 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  26.79 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  26.82 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  27.1 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  24.51 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  27.64 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  30.31 
 
 		 358 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  27.9 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  31.19 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  26.42 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  26.95 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  26.29 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  28.62 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  27.35 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2172  geranylgeranyl reductase  29.15 
 
 		 353 aa  67  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.328813  decreased coverage  0.000000000712182 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2544  geranylgeranyl reductase family protein  29.15 
 
 		 353 aa  67  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  26.72 
 
 		 420 aa  67  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  26.05 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  28.72 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  25.66 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  28.8 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  24.92 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  25.64 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0327  geranylgeranyl reductase  29.2 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.252383  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  52.83 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  24.67 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  24.86 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  29.67 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  28.45 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  29.27 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  24.55 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  28.43 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  27.25 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0709  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  25.37 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2391  geranylgeranyl reductase  29 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1496  hypothetical protein  26.06 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.403861 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0590  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.59 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00186747  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0520  NAD binding site  26.27 
 
 		 377 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  29.21 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05221  NAD binding site  26.14 
 
 		 375 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  27.19 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>