61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0533 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0533  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 278 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.449269  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  31.99 
 
 		 374 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  29.67 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  29.6 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  32.72 
 
 		 376 aa  67  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  30.04 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  31.5 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  31.19 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  29.51 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  24.24 
 
 		 384 aa  59.3  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  29.33 
 
 		 380 aa  58.9  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  27.88 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  26.34 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  26.22 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  36.43 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 		 380 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  28 
 
 		 380 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  25.34 
 
 		 376 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.65 
 
 		 389 aa  53.5  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  27.31 
 
 		 380 aa  53.5  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  29.86 
 
 		 384 aa  53.5  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  26.03 
 
 		 379 aa  53.5  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  27.35 
 
 		 374 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  28.32 
 
 		 421 aa  49.7  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  31.47 
 
 		 436 aa  48.9  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 		 415 aa  48.9  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  31.75 
 
 		 368 aa  48.5  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  29.07 
 
 		 406 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  26.24 
 
 		 390 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  31.29 
 
 		 409 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  27.47 
 
 		 376 aa  47.4  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  26.75 
 
 		 393 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  26.77 
 
 		 379 aa  46.6  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0114  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 399 aa  47  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00154267  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0164  putative electron transfer oxidoreductase  34.71 
 
 		 420 aa  46.2  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  25.45 
 
 		 368 aa  46.2  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  31.36 
 
 		 406 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  31.36 
 
 		 400 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  29.79 
 
 		 431 aa  45.8  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  29.02 
 
 		 363 aa  45.4  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  31.36 
 
 		 406 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  25.76 
 
 		 382 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  25.45 
 
 		 424 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  31.71 
 
 		 375 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  31.94 
 
 		 413 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  26.07 
 
 		 403 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  26.11 
 
 		 393 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 		 393 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 		 393 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5254  geranylgeranyl reductase  29.91 
 
 		 416 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  25.32 
 
 		 390 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 		 390 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 		 393 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1099  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 		 435 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.997696  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  25.73 
 
 		 362 aa  43.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  28.8 
 
 		 418 aa  43.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0808  geranylgeranyl reductase  30.11 
 
 		 406 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  hitchhiker  0.000310699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1604  geranylgeranyl reductase  28.21 
 
 		 391 aa  42.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  27.37 
 
 		 401 aa  42  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  36.13 
 
 		 382 aa  42.4  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  26.99 
 
 		 396 aa  42  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>