More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1602 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  796    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  31.88 
 
 		 378 aa  196  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  32.22 
 
 		 370 aa  166  9e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  32.45 
 
 		 379 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  36.21 
 
 		 385 aa  159  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  31.6 
 
 		 384 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  33.79 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  29.31 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  33.83 
 
 		 368 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  28.9 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  32.63 
 
 		 382 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  28.11 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  33.84 
 
 		 389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  32.62 
 
 		 373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  34.46 
 
 		 373 aa  134  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2391  geranylgeranyl reductase  30.88 
 
 		 375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  28.25 
 
 		 384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  29.24 
 
 		 374 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  29.23 
 
 		 362 aa  130  6e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1604  geranylgeranyl reductase  29.97 
 
 		 391 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  29.63 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  30.95 
 
 		 374 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  28.92 
 
 		 376 aa  123  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  33.12 
 
 		 401 aa  122  9e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  31.32 
 
 		 376 aa  119  7e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  29.68 
 
 		 380 aa  114  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  26.21 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  31.17 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  28.11 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  28.45 
 
 		 423 aa  111  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  28.3 
 
 		 380 aa  109  8.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  28.8 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  30.17 
 
 		 362 aa  109  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  29.06 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  28.45 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  25.69 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  28.45 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  28.44 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  28.88 
 
 		 457 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  28.12 
 
 		 446 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  29.58 
 
 		 379 aa  107  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  25.5 
 
 		 406 aa  106  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  27.78 
 
 		 435 aa  106  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.13 
 
 		 445 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  28.35 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  29.35 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  27.63 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  29.35 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  30.69 
 
 		 380 aa  104  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 		 383 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  29.13 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  26.5 
 
 		 443 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  26.5 
 
 		 443 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  27.74 
 
 		 455 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  27.2 
 
 		 434 aa  103  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  26 
 
 		 425 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  27.93 
 
 		 377 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  28.13 
 
 		 393 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  27.33 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  24.71 
 
 		 421 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  25.93 
 
 		 423 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  28.39 
 
 		 452 aa  100  6e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  26.33 
 
 		 468 aa  99.8  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  27.99 
 
 		 394 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  27.18 
 
 		 376 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  25.97 
 
 		 424 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  27.75 
 
 		 393 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  26.09 
 
 		 406 aa  98.2  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  28.75 
 
 		 411 aa  97.8  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  26.29 
 
 		 434 aa  97.1  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4412  geranylgeranyl reductase  27.74 
 
 		 426 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0475548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  26.38 
 
 		 407 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  28.71 
 
 		 374 aa  96.7  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  26.1 
 
 		 457 aa  95.9  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  28.16 
 
 		 409 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  26.02 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  26.57 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0167  geranylgeranyl reductase  28.24 
 
 		 393 aa  95.5  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  28.53 
 
 		 384 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  28.74 
 
 		 394 aa  95.5  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  26.18 
 
 		 406 aa  93.6  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  25.9 
 
 		 426 aa  93.2  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  25.68 
 
 		 418 aa  92.8  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  25.3 
 
 		 401 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  25.42 
 
 		 419 aa  92  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  26.79 
 
 		 405 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  25.8 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  27.3 
 
 		 402 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  25.79 
 
 		 405 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  29.02 
 
 		 358 aa  91.3  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  25.41 
 
 		 445 aa  91.7  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  24.37 
 
 		 387 aa  90.5  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  27.69 
 
 		 423 aa  89.7  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  26.82 
 
 		 398 aa  89.7  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2679  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 430 aa  89.7  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  27.9 
 
 		 384 aa  89.4  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  27.16 
 
 		 414 aa  89.4  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0709  geranylgeranyl reductase  23.95 
 
 		 377 aa  89.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5367  geranylgeranyl reductase  26.21 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.707854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>