More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1496 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01668  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  98.6 
 
 
429 aa  867    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1943  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  98.6 
 
 
429 aa  867    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633206  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1464  hypothetical protein  80.19 
 
 
428 aa  694    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.682941  normal  0.67626 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01657  hypothetical protein  98.6 
 
 
429 aa  867    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1397  hypothetical protein  76.22 
 
 
429 aa  670    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222986  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1902  hypothetical protein  97.44 
 
 
429 aa  842    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1916  hypothetical protein  97.9 
 
 
429 aa  846    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1496  hypothetical protein  100 
 
 
429 aa  879    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403861 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1820  hypothetical protein  80.42 
 
 
428 aa  696    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1932  hypothetical protein  98.37 
 
 
429 aa  865    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2416  hypothetical protein  98.6 
 
 
429 aa  868    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1992  hypothetical protein  80.42 
 
 
428 aa  696    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.594962  normal  0.0242177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1448  hypothetical protein  80.19 
 
 
428 aa  694    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1482  hypothetical protein  80.19 
 
 
428 aa  693    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839158  normal  0.0909638 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3232  FAD dependent oxidoreductase  61.86 
 
 
430 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2679  FAD dependent oxidoreductase  62.33 
 
 
430 aa  549  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4041  FAD dependent oxidoreductase  60.84 
 
 
429 aa  550  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  60.84 
 
 
428 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  60.84 
 
 
428 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  60.61 
 
 
428 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  60.61 
 
 
428 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  60.37 
 
 
428 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  58.6 
 
 
430 aa  535  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0047  putative oxidoreductase FixC  61.07 
 
 
428 aa  531  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00047  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  61.07 
 
 
428 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  61.07 
 
 
428 aa  530  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  61.07 
 
 
428 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3612  putative oxidoreductase FixC  61.07 
 
 
428 aa  530  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  60.84 
 
 
428 aa  528  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  61.07 
 
 
428 aa  530  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0045  putative oxidoreductase FixC  60.61 
 
 
428 aa  526  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820288  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  56.64 
 
 
429 aa  511  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.35 
 
 
430 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3927  FAD dependent oxidoreductase  48.96 
 
 
431 aa  412  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09250  flavin-dependent dehydrogenase  49.54 
 
 
442 aa  405  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.696714 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1843  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  50.58 
 
 
431 aa  404  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.186881  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3106  FAD dependent oxidoreductase  47.24 
 
 
472 aa  396  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000790545 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1822  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  47.79 
 
 
431 aa  394  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.170222 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27800  flavin-dependent dehydrogenase  45.85 
 
 
439 aa  371  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  41.2 
 
 
432 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2124  hypothetical protein  44.6 
 
 
428 aa  353  2.9999999999999997e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08770  flavin-dependent dehydrogenase  43.45 
 
 
437 aa  340  4e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.9458 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2906  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  42.29 
 
 
423 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4021  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  41.82 
 
 
423 aa  332  5e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3068  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  41.82 
 
 
423 aa  331  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02611  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  41.59 
 
 
423 aa  330  3e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0922  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  41.59 
 
 
423 aa  330  3e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.713397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02574  hypothetical protein  41.59 
 
 
423 aa  330  3e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0946  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  41.59 
 
 
423 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0479  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  40.24 
 
 
425 aa  328  8e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000230935  decreased coverage  0.000263259 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3107  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  41.59 
 
 
422 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.916046  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2895  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  41.36 
 
 
423 aa  325  9e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1434  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  41.83 
 
 
436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000988984  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1370  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  41.03 
 
 
434 aa  310  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2315  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  41.26 
 
 
436 aa  311  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0377746  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  40.15 
 
 
434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1434  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  37.5 
 
 
442 aa  301  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  39.81 
 
 
432 aa  298  9e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2265  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  40.14 
 
 
433 aa  296  4e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00453186  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1478  fixC protein  42.68 
 
 
432 aa  293  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1194  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  42.68 
 
 
432 aa  293  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0537689 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0489  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.5 
 
 
433 aa  293  5e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.905872  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7737  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  40.05 
 
 
436 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393449  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10540  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase, FixC  41.75 
 
 
432 aa  286  5e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106956  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5870  FixC protein  40.39 
 
 
435 aa  285  8e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100427  normal  0.798669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3575  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.59 
 
 
435 aa  285  8e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120471  normal  0.145615 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0060  FAD dependent oxidoreductase  39.71 
 
 
432 aa  285  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012744 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.37 
 
 
430 aa  281  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3614  FAD dependent oxidoreductase  37.24 
 
 
435 aa  280  4e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119671 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0140  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.26 
 
 
435 aa  278  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.942085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1553  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  37.33 
 
 
436 aa  270  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.229666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5084  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  39.02 
 
 
435 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0986  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  37.96 
 
 
435 aa  266  8e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.105953 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0648  FAD dependent oxidoreductase  37.3 
 
 
424 aa  265  8e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.567553  hitchhiker  0.0038978 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2369  FAD dependent oxidoreductase  37.18 
 
 
424 aa  265  2e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2135  FAD dependent oxidoreductase  39.09 
 
 
424 aa  264  3e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0129  FAD dependent oxidoreductase  37.14 
 
 
436 aa  263  4e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4446  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  37.47 
 
 
435 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1540  FAD dependent oxidoreductase  38.92 
 
 
431 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4013  FAD dependent oxidoreductase  35.4 
 
 
435 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1090  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  37.71 
 
 
435 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5046  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.48 
 
 
435 aa  256  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113413  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0958  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  39.76 
 
 
437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6230  FAD dependent oxidoreductase  37.13 
 
 
435 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2000  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.17 
 
 
426 aa  251  1e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2198  FAD dependent oxidoreductase  38.9 
 
 
446 aa  249  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3860  FAD dependent oxidoreductase  36.32 
 
 
438 aa  248  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00230775  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1937  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  37.88 
 
 
431 aa  245  9e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4927  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.98 
 
 
435 aa  245  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1195  FAD dependent oxidoreductase  35.02 
 
 
438 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  35.02 
 
 
438 aa  239  8e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3598  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.93 
 
 
438 aa  233  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0590  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.25 
 
 
407 aa  227  4e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00186747  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0333  FAD dependent oxidoreductase  35.82 
 
 
401 aa  207  3e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.882916  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00140  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.13 
 
 
388 aa  187  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2615  FAD dependent oxidoreductase  33.85 
 
 
553 aa  182  9.000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.489125  normal  0.819562 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0484  monooxygenase FAD-binding protein  34.04 
 
 
561 aa  172  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35565  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  30.57 
 
 
395 aa  158  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3065  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.46 
 
 
571 aa  146  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1266  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  29.95 
 
 
541 aa  139  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.863142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>