More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1397 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01668  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  76.69 
 
 		 429 aa  676    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1943  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  76.46 
 
 		 429 aa  674    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633206  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01657  hypothetical protein  76.69 
 
 		 429 aa  676    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1992  hypothetical protein  75.99 
 
 		 428 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.594962  normal  0.0242177 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1482  hypothetical protein  75.99 
 
 		 428 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839158  normal  0.0909638 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1932  hypothetical protein  76.22 
 
 		 429 aa  672    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1448  hypothetical protein  75.99 
 
 		 428 aa  656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1397  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  876    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222986  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1464  hypothetical protein  75.99 
 
 		 428 aa  656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.682941  normal  0.67626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2416  hypothetical protein  76.22 
 
 		 429 aa  674    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1496  hypothetical protein  76.22 
 
 		 429 aa  672    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.403861 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1902  hypothetical protein  75.76 
 
 		 429 aa  671    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1916  hypothetical protein  75.99 
 
 		 429 aa  674    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1820  hypothetical protein  75.99 
 
 		 428 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3232  FAD dependent oxidoreductase  64.42 
 
 		 430 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4041  FAD dependent oxidoreductase  62.47 
 
 		 429 aa  569  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2679  FAD dependent oxidoreductase  63.95 
 
 		 430 aa  568  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  60.61 
 
 		 428 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  60.61 
 
 		 428 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  60.37 
 
 		 428 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  60.37 
 
 		 428 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  60.37 
 
 		 428 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0047  putative oxidoreductase FixC  62 
 
 		 428 aa  536  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00047  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  62 
 
 		 428 aa  534  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  62 
 
 		 428 aa  534  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  62 
 
 		 428 aa  534  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3612  putative oxidoreductase FixC  62 
 
 		 428 aa  534  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  62 
 
 		 428 aa  534  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  61.77 
 
 		 428 aa  531  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0045  putative oxidoreductase FixC  61.77 
 
 		 428 aa  531  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820288  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  56.98 
 
 		 430 aa  530  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.65 
 
 		 430 aa  509  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  56.18 
 
 		 429 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1843  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  52.2 
 
 		 431 aa  427  1e-118  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.186881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3927  FAD dependent oxidoreductase  49.88 
 
 		 431 aa  423  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3106  FAD dependent oxidoreductase  49.77 
 
 		 472 aa  418  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000790545 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1822  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  50.35 
 
 		 431 aa  417  9.999999999999999e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.170222 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09250  flavin-dependent dehydrogenase  49.66 
 
 		 442 aa  415  1e-114  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.696714 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27800  flavin-dependent dehydrogenase  47 
 
 		 439 aa  386  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  41.9 
 
 		 432 aa  375  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08770  flavin-dependent dehydrogenase  45.29 
 
 		 437 aa  363  4e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.9458 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2124  hypothetical protein  43.5 
 
 		 428 aa  354  2e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2906  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  42.36 
 
 		 423 aa  330  4e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4021  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  42.12 
 
 		 423 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3068  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  42.12 
 
 		 423 aa  329  7e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02611  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  41.87 
 
 		 423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0922  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  41.87 
 
 		 423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.713397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02574  hypothetical protein  41.87 
 
 		 423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0946  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  41.87 
 
 		 423 aa  327  3e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0479  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  40.09 
 
 		 425 aa  324  2e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000230935  decreased coverage  0.000263259 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2895  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  41.87 
 
 		 423 aa  323  3e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3107  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  41.87 
 
 		 422 aa  319  5e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.916046  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1370  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  40.79 
 
 		 434 aa  317  3e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1434  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  40.34 
 
 		 442 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2265  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  41.67 
 
 		 433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00453186  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2315  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  39.86 
 
 		 436 aa  313  4.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0377746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0489  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  39.42 
 
 		 433 aa  311  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.905872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1434  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  40.38 
 
 		 436 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000988984  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5870  FixC protein  41.16 
 
 		 435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100427  normal  0.798669 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0140  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  41.38 
 
 		 435 aa  309  5.9999999999999995e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.942085 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  40.14 
 
 		 432 aa  306  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1478  fixC protein  41.71 
 
 		 432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1194  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  41.71 
 
 		 432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0537689 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  38.98 
 
 		 434 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3575  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  37.61 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120471  normal  0.145615 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10540  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase, FixC  43.11 
 
 		 432 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106956  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7737  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  40.05 
 
 		 436 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1553  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.3 
 
 		 436 aa  294  3e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.229666 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0060  FAD dependent oxidoreductase  40.69 
 
 		 432 aa  291  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5084  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  40 
 
 		 435 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0986  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  39.16 
 
 		 435 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.105953 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3614  FAD dependent oxidoreductase  37.7 
 
 		 435 aa  291  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119671 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.6 
 
 		 430 aa  289  6e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0648  FAD dependent oxidoreductase  39.3 
 
 		 424 aa  288  1e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.567553  hitchhiker  0.0038978 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2135  FAD dependent oxidoreductase  40.24 
 
 		 424 aa  288  2e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1090  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.77 
 
 		 435 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2369  FAD dependent oxidoreductase  39.09 
 
 		 424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4446  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.02 
 
 		 435 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1540  FAD dependent oxidoreductase  40.59 
 
 		 431 aa  282  9e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4013  FAD dependent oxidoreductase  39.16 
 
 		 435 aa  279  8e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2000  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  42.11 
 
 		 426 aa  278  1e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5046  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  37.47 
 
 		 435 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0129  FAD dependent oxidoreductase  40.6 
 
 		 436 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0958  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  40.24 
 
 		 437 aa  266  5.999999999999999e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6230  FAD dependent oxidoreductase  38.12 
 
 		 435 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1937  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  38.59 
 
 		 431 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4927  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  37.13 
 
 		 435 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3860  FAD dependent oxidoreductase  38.19 
 
 		 438 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00230775  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3598  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  39.85 
 
 		 438 aa  252  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1195  FAD dependent oxidoreductase  34.78 
 
 		 438 aa  248  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  34.63 
 
 		 438 aa  246  4e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2198  FAD dependent oxidoreductase  37.68 
 
 		 446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0590  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.42 
 
 		 407 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00186747  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00140  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  34.62 
 
 		 388 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0333  FAD dependent oxidoreductase  34.23 
 
 		 401 aa  197  4.0000000000000005e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.882916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2615  FAD dependent oxidoreductase  33.07 
 
 		 553 aa  177  3e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.489125  normal  0.819562 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0484  monooxygenase FAD-binding protein  34.04 
 
 		 561 aa  172  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35565  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3065  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.96 
 
 		 571 aa  154  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  31.36 
 
 		 395 aa  141  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2059  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  30.16 
 
 		 558 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>