More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1478 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1194  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  100 
 
 
432 aa  890    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0537689 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1478  fixC protein  100 
 
 
432 aa  890    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1370  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.28 
 
 
434 aa  649    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2315  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  68.91 
 
 
436 aa  625  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0377746  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1434  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  68.91 
 
 
436 aa  622  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000988984  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7737  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  67.98 
 
 
436 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393449  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10540  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase, FixC  66.82 
 
 
432 aa  595  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106956  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0489  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  64.27 
 
 
433 aa  590  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.905872  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2265  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  62.36 
 
 
433 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00453186  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0140  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  63.89 
 
 
435 aa  569  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.942085 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5084  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  62.9 
 
 
435 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1090  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.75 
 
 
435 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0986  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.75 
 
 
435 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.105953 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1553  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.88 
 
 
436 aa  551  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.229666 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5870  FixC protein  61.75 
 
 
435 aa  547  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100427  normal  0.798669 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4446  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.57 
 
 
435 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3614  FAD dependent oxidoreductase  61.06 
 
 
435 aa  541  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3575  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.56 
 
 
435 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120471  normal  0.145615 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4013  FAD dependent oxidoreductase  58.8 
 
 
435 aa  529  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4927  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.41 
 
 
435 aa  511  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6230  FAD dependent oxidoreductase  59.26 
 
 
435 aa  506  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5046  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.48 
 
 
435 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113413  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1540  FAD dependent oxidoreductase  51.16 
 
 
431 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0060  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 
432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012744 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1937  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  48.61 
 
 
431 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  44.78 
 
 
430 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1195  FAD dependent oxidoreductase  44.8 
 
 
438 aa  369  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  44.8 
 
 
438 aa  370  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0958  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  45.37 
 
 
437 aa  352  8.999999999999999e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3598  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  44.91 
 
 
438 aa  339  7e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  43.14 
 
 
434 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  42.11 
 
 
429 aa  310  5e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  43.07 
 
 
428 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  39.53 
 
 
430 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  43.07 
 
 
428 aa  306  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  42.82 
 
 
428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  42.82 
 
 
428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1397  hypothetical protein  41.71 
 
 
429 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222986  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  42.82 
 
 
428 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01668  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  43.17 
 
 
429 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  39.12 
 
 
430 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01657  hypothetical protein  43.17 
 
 
429 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1943  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  43.17 
 
 
429 aa  301  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633206  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2416  hypothetical protein  42.68 
 
 
429 aa  300  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1932  hypothetical protein  42.93 
 
 
429 aa  299  7e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1496  hypothetical protein  42.68 
 
 
429 aa  298  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403861 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1916  hypothetical protein  42.44 
 
 
429 aa  298  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4041  FAD dependent oxidoreductase  40.54 
 
 
429 aa  297  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3232  FAD dependent oxidoreductase  39.71 
 
 
430 aa  297  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.9 
 
 
432 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3927  FAD dependent oxidoreductase  41.15 
 
 
431 aa  295  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1902  hypothetical protein  42.3 
 
 
429 aa  294  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1822  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  37 
 
 
431 aa  291  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.170222 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3106  FAD dependent oxidoreductase  37.26 
 
 
472 aa  291  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000790545 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2679  FAD dependent oxidoreductase  38.64 
 
 
430 aa  288  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0047  putative oxidoreductase FixC  41.38 
 
 
428 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00047  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  41.38 
 
 
428 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  41.38 
 
 
428 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3612  putative oxidoreductase FixC  41.38 
 
 
428 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  41.38 
 
 
428 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  41.38 
 
 
428 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  41.38 
 
 
428 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  38.48 
 
 
432 aa  285  9e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0045  putative oxidoreductase FixC  40.89 
 
 
428 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820288  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2124  hypothetical protein  40.74 
 
 
428 aa  281  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1820  hypothetical protein  39.81 
 
 
428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1992  hypothetical protein  39.81 
 
 
428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.594962  normal  0.0242177 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1464  hypothetical protein  40.93 
 
 
428 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.682941  normal  0.67626 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1448  hypothetical protein  40.69 
 
 
428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1482  hypothetical protein  39.81 
 
 
428 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839158  normal  0.0909638 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0479  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  37.97 
 
 
425 aa  268  2e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000230935  decreased coverage  0.000263259 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09250  flavin-dependent dehydrogenase  37.59 
 
 
442 aa  261  1e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.696714 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0129  FAD dependent oxidoreductase  34.92 
 
 
436 aa  261  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1843  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  37.04 
 
 
431 aa  261  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.186881  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1434  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  33.63 
 
 
442 aa  257  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27800  flavin-dependent dehydrogenase  36.94 
 
 
439 aa  249  7e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2198  FAD dependent oxidoreductase  38.11 
 
 
446 aa  248  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00140  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.2 
 
 
388 aa  243  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08770  flavin-dependent dehydrogenase  35.21 
 
 
437 aa  243  3e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.9458 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3860  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 
438 aa  233  7.000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00230775  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3068  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  33.49 
 
 
423 aa  229  5e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2906  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  33.73 
 
 
423 aa  229  7e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02611  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  33.49 
 
 
423 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0922  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.49 
 
 
423 aa  228  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.713397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0946  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.49 
 
 
423 aa  228  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02574  hypothetical protein  33.49 
 
 
423 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4021  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  33.25 
 
 
423 aa  226  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2895  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  33.25 
 
 
423 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3107  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  33.73 
 
 
422 aa  224  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.916046  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2369  FAD dependent oxidoreductase  36.39 
 
 
424 aa  211  2e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0648  FAD dependent oxidoreductase  35.84 
 
 
424 aa  205  1e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.567553  hitchhiker  0.0038978 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2000  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.87 
 
 
426 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2135  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 
424 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  35.05 
 
 
395 aa  173  5e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0590  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.12 
 
 
407 aa  173  5.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00186747  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0333  FAD dependent oxidoreductase  32.26 
 
 
401 aa  160  4e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.882916  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2615  FAD dependent oxidoreductase  33.6 
 
 
553 aa  150  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.489125  normal  0.819562 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1221  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  30.67 
 
 
541 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.022805  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1266  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  30.67 
 
 
541 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.863142  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3065  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  30 
 
 
571 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>