More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_27800 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_27800  flavin-dependent dehydrogenase  100 
 
 
439 aa  898    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08770  flavin-dependent dehydrogenase  71.4 
 
 
437 aa  621  1e-177  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.9458 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3106  FAD dependent oxidoreductase  66.36 
 
 
472 aa  592  1e-168  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000790545 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1822  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  66.44 
 
 
431 aa  589  1e-167  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.170222 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09250  flavin-dependent dehydrogenase  57.94 
 
 
442 aa  502  1e-141  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.696714 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  50.71 
 
 
430 aa  428  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  49.65 
 
 
430 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1843  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  50.46 
 
 
431 aa  412  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.186881  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3232  FAD dependent oxidoreductase  48.74 
 
 
430 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4041  FAD dependent oxidoreductase  48.62 
 
 
429 aa  410  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2679  FAD dependent oxidoreductase  47.8 
 
 
430 aa  397  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  47.71 
 
 
429 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1397  hypothetical protein  47 
 
 
429 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222986  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  46.15 
 
 
428 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1496  hypothetical protein  45.85 
 
 
429 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403861 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1902  hypothetical protein  45.39 
 
 
429 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2416  hypothetical protein  45.62 
 
 
429 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  45.92 
 
 
428 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  45.92 
 
 
428 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  45.92 
 
 
428 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  45.92 
 
 
428 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1916  hypothetical protein  45.62 
 
 
429 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01668  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  45.62 
 
 
429 aa  372  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1943  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  45.62 
 
 
429 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633206  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1932  hypothetical protein  45.39 
 
 
429 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01657  hypothetical protein  45.62 
 
 
429 aa  372  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1820  hypothetical protein  45.85 
 
 
428 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1992  hypothetical protein  45.85 
 
 
428 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.594962  normal  0.0242177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1448  hypothetical protein  45.85 
 
 
428 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1482  hypothetical protein  45.85 
 
 
428 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839158  normal  0.0909638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1464  hypothetical protein  45.85 
 
 
428 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.682941  normal  0.67626 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00047  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  44.99 
 
 
428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  44.99 
 
 
428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3612  putative oxidoreductase FixC  44.99 
 
 
428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  44.99 
 
 
428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  44.99 
 
 
428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0047  putative oxidoreductase FixC  44.76 
 
 
428 aa  356  5e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  44.76 
 
 
428 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0045  putative oxidoreductase FixC  44.76 
 
 
428 aa  354  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820288  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3927  FAD dependent oxidoreductase  44.34 
 
 
431 aa  336  5e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.8 
 
 
432 aa  311  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2124  hypothetical protein  42.24 
 
 
428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1434  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  37.39 
 
 
442 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0479  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.43 
 
 
425 aa  264  2e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000230935  decreased coverage  0.000263259 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5870  FixC protein  37.86 
 
 
435 aa  260  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100427  normal  0.798669 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3614  FAD dependent oxidoreductase  37.12 
 
 
435 aa  260  4e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119671 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1090  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  37.23 
 
 
435 aa  259  9e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0489  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  34.47 
 
 
433 aa  258  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.905872  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0986  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.5 
 
 
435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.105953 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  38.19 
 
 
434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3068  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  35.38 
 
 
423 aa  254  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2906  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  35.14 
 
 
423 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5084  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.98 
 
 
435 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02611  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  35.14 
 
 
423 aa  253  7e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0922  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.14 
 
 
423 aa  253  7e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.713397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02574  hypothetical protein  35.14 
 
 
423 aa  253  7e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0946  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.14 
 
 
423 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2265  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  34.04 
 
 
433 aa  251  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00453186  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4021  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.91 
 
 
423 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1370  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  34.72 
 
 
434 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0140  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  34.78 
 
 
435 aa  250  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.942085 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4927  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.68 
 
 
435 aa  250  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4446  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.74 
 
 
435 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1478  fixC protein  36.94 
 
 
432 aa  249  7e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1194  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.94 
 
 
432 aa  249  7e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0537689 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2895  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.67 
 
 
423 aa  248  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.32 
 
 
430 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3107  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.99 
 
 
422 aa  248  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.916046  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3575  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  34.04 
 
 
435 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120471  normal  0.145615 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10540  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase, FixC  36.57 
 
 
432 aa  245  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106956  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2315  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  34.46 
 
 
436 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0377746  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4013  FAD dependent oxidoreductase  34.31 
 
 
435 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1434  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  34.22 
 
 
436 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000988984  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  34.86 
 
 
432 aa  236  8e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1540  FAD dependent oxidoreductase  35.17 
 
 
431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7737  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  34.46 
 
 
436 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393449  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0060  FAD dependent oxidoreductase  34.34 
 
 
432 aa  233  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012744 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1195  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 
438 aa  233  5e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5046  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.42 
 
 
435 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113413  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 
438 aa  231  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1553  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  32.2 
 
 
436 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.229666 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1937  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  34.3 
 
 
431 aa  230  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6230  FAD dependent oxidoreductase  35.19 
 
 
435 aa  227  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0958  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  34.43 
 
 
437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3598  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.96 
 
 
438 aa  219  7.999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2000  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.09 
 
 
426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2135  FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 
424 aa  212  9e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0648  FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 
424 aa  211  2e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.567553  hitchhiker  0.0038978 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2369  FAD dependent oxidoreductase  36.14 
 
 
424 aa  211  3e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2198  FAD dependent oxidoreductase  34.43 
 
 
446 aa  207  3e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0129  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 
436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0590  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.33 
 
 
407 aa  182  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00186747  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0333  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 
401 aa  181  2e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.882916  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3860  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 
438 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00230775  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00140  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.66 
 
 
388 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  30.09 
 
 
395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0484  monooxygenase FAD-binding protein  33.93 
 
 
561 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35565  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2615  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 
553 aa  117  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.489125  normal  0.819562 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1239  hypothetical protein  23.62 
 
 
543 aa  111  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1239  hypothetical protein  23.37 
 
 
543 aa  110  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>