More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5046 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5046  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  100 
 
 
435 aa  900    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113413  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6230  FAD dependent oxidoreductase  74.25 
 
 
435 aa  655    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4927  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  85.98 
 
 
435 aa  790    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4446  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  68.75 
 
 
435 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0986  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  68.05 
 
 
435 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.105953 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1090  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  67.82 
 
 
435 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5870  FixC protein  67.82 
 
 
435 aa  595  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100427  normal  0.798669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3575  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  65.75 
 
 
435 aa  594  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120471  normal  0.145615 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5084  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  67.36 
 
 
435 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3614  FAD dependent oxidoreductase  65.75 
 
 
435 aa  586  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119671 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0140  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  65.74 
 
 
435 aa  587  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.942085 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0489  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  62.99 
 
 
433 aa  578  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.905872  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4013  FAD dependent oxidoreductase  64.6 
 
 
435 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1553  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.09 
 
 
436 aa  544  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.229666 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2265  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  58.1 
 
 
433 aa  529  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00453186  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1370  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.84 
 
 
434 aa  496  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1194  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.48 
 
 
432 aa  490  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0537689 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1434  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.28 
 
 
436 aa  490  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000988984  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1478  fixC protein  56.48 
 
 
432 aa  490  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10540  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase, FixC  57.21 
 
 
432 aa  481  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106956  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7737  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.28 
 
 
436 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393449  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2315  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.21 
 
 
436 aa  481  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0377746  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1540  FAD dependent oxidoreductase  46.3 
 
 
431 aa  346  5e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0060  FAD dependent oxidoreductase  43.19 
 
 
432 aa  338  9.999999999999999e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012744 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1195  FAD dependent oxidoreductase  41.08 
 
 
438 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  41.31 
 
 
438 aa  326  5e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  39.72 
 
 
430 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1937  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  43.49 
 
 
431 aa  310  4e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0958  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  39.95 
 
 
437 aa  303  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3598  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  39.72 
 
 
438 aa  293  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  39.55 
 
 
429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  37.91 
 
 
434 aa  275  8e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3232  FAD dependent oxidoreductase  35.64 
 
 
430 aa  262  8e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4041  FAD dependent oxidoreductase  36.07 
 
 
429 aa  261  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1397  hypothetical protein  37.47 
 
 
429 aa  261  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222986  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.43 
 
 
430 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  32.95 
 
 
432 aa  260  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1822  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  36.25 
 
 
431 aa  259  5.0000000000000005e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.170222 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3106  FAD dependent oxidoreductase  36.41 
 
 
472 aa  259  6e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000790545 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  36.38 
 
 
432 aa  255  8e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  36.07 
 
 
430 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2416  hypothetical protein  35.82 
 
 
429 aa  250  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01668  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  36.48 
 
 
429 aa  249  7e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01657  hypothetical protein  36.48 
 
 
429 aa  249  7e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2679  FAD dependent oxidoreductase  35.48 
 
 
430 aa  249  9e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.678719 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1943  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.07 
 
 
429 aa  248  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633206  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1496  hypothetical protein  36.48 
 
 
429 aa  248  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403861 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1916  hypothetical protein  36.07 
 
 
429 aa  248  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2124  hypothetical protein  36.7 
 
 
428 aa  248  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1932  hypothetical protein  35.82 
 
 
429 aa  246  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3927  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 
431 aa  246  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1902  hypothetical protein  35.82 
 
 
429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  34.41 
 
 
428 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  34.41 
 
 
428 aa  242  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  34.16 
 
 
428 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  34.16 
 
 
428 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0047  putative oxidoreductase FixC  35.4 
 
 
428 aa  238  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  33.91 
 
 
428 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  35.15 
 
 
428 aa  236  6e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00047  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  35.15 
 
 
428 aa  236  6e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  35.15 
 
 
428 aa  236  6e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3612  putative oxidoreductase FixC  35.15 
 
 
428 aa  236  6e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  35.15 
 
 
428 aa  236  6e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09250  flavin-dependent dehydrogenase  34.9 
 
 
442 aa  235  9e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.696714 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  35.15 
 
 
428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0045  putative oxidoreductase FixC  34.9 
 
 
428 aa  233  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820288  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1820  hypothetical protein  36.86 
 
 
428 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1992  hypothetical protein  36.86 
 
 
428 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.594962  normal  0.0242177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1448  hypothetical protein  36.86 
 
 
428 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1464  hypothetical protein  36.86 
 
 
428 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.682941  normal  0.67626 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1482  hypothetical protein  36.86 
 
 
428 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839158  normal  0.0909638 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0129  FAD dependent oxidoreductase  32.65 
 
 
436 aa  226  8e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1843  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  34.74 
 
 
431 aa  222  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.186881  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2198  FAD dependent oxidoreductase  36.47 
 
 
446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27800  flavin-dependent dehydrogenase  33.42 
 
 
439 aa  221  3e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08770  flavin-dependent dehydrogenase  33.01 
 
 
437 aa  221  3e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.9458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1434  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  32.93 
 
 
442 aa  219  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0479  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.91 
 
 
425 aa  217  2.9999999999999998e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000230935  decreased coverage  0.000263259 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3860  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 
438 aa  210  5e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00230775  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2906  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.62 
 
 
423 aa  205  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02611  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  32.62 
 
 
423 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0922  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  32.62 
 
 
423 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.713397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02574  hypothetical protein  32.62 
 
 
423 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4021  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.62 
 
 
423 aa  204  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3068  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.62 
 
 
423 aa  204  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0946  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  32.62 
 
 
423 aa  204  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00140  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  30.43 
 
 
388 aa  202  8e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3107  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.46 
 
 
422 aa  202  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.916046  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2895  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.14 
 
 
423 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0648  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 
424 aa  188  1e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.567553  hitchhiker  0.0038978 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2000  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  32.66 
 
 
426 aa  186  6e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2135  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 
424 aa  180  4e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2369  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 
424 aa  180  4.999999999999999e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0590  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.35 
 
 
407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00186747  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  34.56 
 
 
395 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0333  FAD dependent oxidoreductase  32.18 
 
 
401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.882916  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1249  FAD dependent oxidoreductase  35.58 
 
 
387 aa  146  6e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2615  FAD dependent oxidoreductase  32.5 
 
 
553 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.489125  normal  0.819562 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001581  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  28.08 
 
 
553 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1221  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  28.22 
 
 
541 aa  124  5e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.022805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>