More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_00140 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_00140  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  100 
 
 
388 aa  798    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0129  FAD dependent oxidoreductase  50.26 
 
 
436 aa  431  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0060  FAD dependent oxidoreductase  38.62 
 
 
432 aa  291  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012744 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10540  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase, FixC  39.59 
 
 
432 aa  260  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106956  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.59 
 
 
430 aa  258  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1370  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.2 
 
 
434 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1434  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.13 
 
 
436 aa  255  9e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000988984  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2315  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  37.9 
 
 
436 aa  249  8e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0377746  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0489  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.59 
 
 
433 aa  247  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.905872  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5084  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.29 
 
 
435 aa  245  9e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1194  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.2 
 
 
432 aa  243  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0537689 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1478  fixC protein  36.2 
 
 
432 aa  243  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0986  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.53 
 
 
435 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.105953 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1090  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  37.9 
 
 
435 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7737  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.41 
 
 
436 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393449  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1937  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  35.57 
 
 
431 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1540  FAD dependent oxidoreductase  34.79 
 
 
431 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2265  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  33.67 
 
 
433 aa  235  8e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00453186  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0140  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.48 
 
 
435 aa  233  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.942085 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3614  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 
435 aa  229  8e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119671 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4446  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  34.9 
 
 
435 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5870  FixC protein  35.38 
 
 
435 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100427  normal  0.798669 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.06 
 
 
432 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1553  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  31.5 
 
 
436 aa  223  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.229666 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3575  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  31.97 
 
 
435 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120471  normal  0.145615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0958  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.86 
 
 
437 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  37.05 
 
 
430 aa  216  7e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  39.87 
 
 
434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1195  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 
438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  33.72 
 
 
438 aa  210  4e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3232  FAD dependent oxidoreductase  35.69 
 
 
430 aa  208  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4927  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  32.86 
 
 
435 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  35.84 
 
 
430 aa  206  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3598  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.95 
 
 
438 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4013  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 
435 aa  203  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5046  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  30.43 
 
 
435 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113413  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2679  FAD dependent oxidoreductase  32.82 
 
 
430 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  34.35 
 
 
432 aa  199  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3927  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 
431 aa  199  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4041  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 
429 aa  199  9e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  36.57 
 
 
428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  36.57 
 
 
428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  36.57 
 
 
428 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  34.9 
 
 
429 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  36.25 
 
 
428 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2124  hypothetical protein  35.87 
 
 
428 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  35.92 
 
 
428 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0047  putative oxidoreductase FixC  36.33 
 
 
428 aa  192  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00047  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  36.01 
 
 
428 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  36.01 
 
 
428 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  36.01 
 
 
428 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  36.01 
 
 
428 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1434  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  33.96 
 
 
442 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3612  putative oxidoreductase FixC  36.01 
 
 
428 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  36.01 
 
 
428 aa  190  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0045  putative oxidoreductase FixC  35.69 
 
 
428 aa  188  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820288  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6230  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 
435 aa  186  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1397  hypothetical protein  34.62 
 
 
429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222986  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2416  hypothetical protein  33.43 
 
 
429 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01668  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  33.43 
 
 
429 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01657  hypothetical protein  33.43 
 
 
429 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1943  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.43 
 
 
429 aa  179  8e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633206  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1932  hypothetical protein  33.43 
 
 
429 aa  179  9e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1916  hypothetical protein  33.13 
 
 
429 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3106  FAD dependent oxidoreductase  32.82 
 
 
472 aa  178  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000790545 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1902  hypothetical protein  33.13 
 
 
429 aa  178  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1496  hypothetical protein  33.13 
 
 
429 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403861 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1822  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  32.3 
 
 
431 aa  176  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.170222 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1843  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  33.24 
 
 
431 aa  176  8e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.186881  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1820  hypothetical protein  33.83 
 
 
428 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1992  hypothetical protein  33.83 
 
 
428 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.594962  normal  0.0242177 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1464  hypothetical protein  33.83 
 
 
428 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.682941  normal  0.67626 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1482  hypothetical protein  33.83 
 
 
428 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839158  normal  0.0909638 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1448  hypothetical protein  33.53 
 
 
428 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0479  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.64 
 
 
425 aa  171  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000230935  decreased coverage  0.000263259 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08770  flavin-dependent dehydrogenase  31.56 
 
 
437 aa  159  6e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.9458 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27800  flavin-dependent dehydrogenase  28.66 
 
 
439 aa  152  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02611  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  29.41 
 
 
423 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0922  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  29.41 
 
 
423 aa  150  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.713397  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3068  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.24 
 
 
423 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02574  hypothetical protein  29.41 
 
 
423 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0946  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  29.24 
 
 
423 aa  150  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09250  flavin-dependent dehydrogenase  30.58 
 
 
442 aa  149  6e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.696714 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2906  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.24 
 
 
423 aa  149  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4021  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.24 
 
 
423 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3107  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.53 
 
 
422 aa  145  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.916046  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0648  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 
424 aa  145  1e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.567553  hitchhiker  0.0038978 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2895  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.65 
 
 
423 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2198  FAD dependent oxidoreductase  32.57 
 
 
446 aa  142  9e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2135  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 
424 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2000  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  32.42 
 
 
426 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2369  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 
424 aa  139  6e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3860  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 
438 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00230775  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3065  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  27.16 
 
 
571 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0590  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.2 
 
 
407 aa  108  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00186747  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1891  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  26.76 
 
 
556 aa  105  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0333  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 
401 aa  103  7e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.882916  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1800  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  27.35 
 
 
545 aa  98.6  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2059  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  27.67 
 
 
558 aa  96.3  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2090  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  26.3 
 
 
557 aa  94.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.522726  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>