More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3232 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3232  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 430 aa  878    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2679  FAD dependent oxidoreductase  87.44 
 
 		 430 aa  772    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4041  FAD dependent oxidoreductase  88.84 
 
 		 429 aa  782    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  63.49 
 
 		 428 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  63.26 
 
 		 428 aa  574  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  63.26 
 
 		 428 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  63.49 
 
 		 428 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  63.26 
 
 		 428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1397  hypothetical protein  64.42 
 
 		 429 aa  565  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222986  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  60.32 
 
 		 430 aa  554  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  61.63 
 
 		 429 aa  551  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3612  putative oxidoreductase FixC  62.56 
 
 		 428 aa  550  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00047  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  62.56 
 
 		 428 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  62.56 
 
 		 428 aa  550  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  62.56 
 
 		 428 aa  550  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0047  putative oxidoreductase FixC  62.56 
 
 		 428 aa  550  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0045  putative oxidoreductase FixC  62.56 
 
 		 428 aa  548  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820288  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  62.56 
 
 		 428 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01668  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  61.4 
 
 		 429 aa  545  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01657  hypothetical protein  61.4 
 
 		 429 aa  545  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  62.33 
 
 		 428 aa  547  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2416  hypothetical protein  61.4 
 
 		 429 aa  546  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1496  hypothetical protein  61.86 
 
 		 429 aa  547  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.403861 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1916  hypothetical protein  61.16 
 
 		 429 aa  545  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1943  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.4 
 
 		 429 aa  543  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633206  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1932  hypothetical protein  61.16 
 
 		 429 aa  542  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1902  hypothetical protein  60.93 
 
 		 429 aa  542  1e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1820  hypothetical protein  60.47 
 
 		 428 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1992  hypothetical protein  60.47 
 
 		 428 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.594962  normal  0.0242177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1448  hypothetical protein  60.47 
 
 		 428 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1464  hypothetical protein  60.47 
 
 		 428 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.682941  normal  0.67626 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.84 
 
 		 430 aa  527  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1482  hypothetical protein  60.47 
 
 		 428 aa  528  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839158  normal  0.0909638 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1843  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  50.81 
 
 		 431 aa  428  1e-118  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.186881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3927  FAD dependent oxidoreductase  48.15 
 
 		 431 aa  419  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3106  FAD dependent oxidoreductase  48.96 
 
 		 472 aa  417  9.999999999999999e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000790545 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09250  flavin-dependent dehydrogenase  50.23 
 
 		 442 aa  410  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.696714 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1822  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  48.49 
 
 		 431 aa  410  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.170222 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27800  flavin-dependent dehydrogenase  48.74 
 
 		 439 aa  393  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  42.63 
 
 		 432 aa  364  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2124  hypothetical protein  46.1 
 
 		 428 aa  354  1e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08770  flavin-dependent dehydrogenase  44.42 
 
 		 437 aa  353  4e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.9458 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0479  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  43.13 
 
 		 425 aa  347  2e-94  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000230935  decreased coverage  0.000263259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1370  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  40.33 
 
 		 434 aa  316  5e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  40.33 
 
 		 432 aa  315  9e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2265  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  40.19 
 
 		 433 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00453186  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1434  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  38.76 
 
 		 442 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4021  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  38.5 
 
 		 423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0489  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  39.86 
 
 		 433 aa  303  4.0000000000000003e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.905872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2906  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  38.26 
 
 		 423 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0140  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  41.59 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.942085 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3068  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  38.01 
 
 		 423 aa  300  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5870  FixC protein  43.03 
 
 		 435 aa  300  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100427  normal  0.798669 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2315  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.34 
 
 		 436 aa  300  5e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0377746  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02611  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  38.01 
 
 		 423 aa  298  9e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0922  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.01 
 
 		 423 aa  298  9e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.713397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02574  hypothetical protein  38.01 
 
 		 423 aa  298  9e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0946  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.01 
 
 		 423 aa  298  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1553  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  39.22 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.229666 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2895  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  37.29 
 
 		 423 aa  292  7e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3107  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  37.77 
 
 		 422 aa  291  1e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.916046  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3614  FAD dependent oxidoreductase  38.53 
 
 		 435 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119671 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1434  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  37.2 
 
 		 436 aa  289  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000988984  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5084  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  40.72 
 
 		 435 aa  289  8e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7737  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.41 
 
 		 436 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10540  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase, FixC  41.96 
 
 		 432 aa  286  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106956  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0986  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  40.99 
 
 		 435 aa  286  7e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.105953 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  38.2 
 
 		 434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4446  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  39.13 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0060  FAD dependent oxidoreductase  39.17 
 
 		 432 aa  284  3.0000000000000004e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012744 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.66 
 
 		 430 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1478  fixC protein  39.71 
 
 		 432 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1194  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  39.71 
 
 		 432 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0537689 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1090  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  39.66 
 
 		 435 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3575  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.57 
 
 		 435 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120471  normal  0.145615 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3860  FAD dependent oxidoreductase  39.35 
 
 		 438 aa  277  3e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00230775  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0648  FAD dependent oxidoreductase  41.88 
 
 		 424 aa  276  5e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.567553  hitchhiker  0.0038978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4013  FAD dependent oxidoreductase  36.72 
 
 		 435 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2135  FAD dependent oxidoreductase  39.9 
 
 		 424 aa  271  2e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1540  FAD dependent oxidoreductase  40.15 
 
 		 431 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6230  FAD dependent oxidoreductase  38.88 
 
 		 435 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4927  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.11 
 
 		 435 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2000  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  40.71 
 
 		 426 aa  265  8e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0958  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  37.92 
 
 		 437 aa  265  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5046  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.64 
 
 		 435 aa  262  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1937  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  39.27 
 
 		 431 aa  259  9e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1195  FAD dependent oxidoreductase  37.14 
 
 		 438 aa  258  2e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  36.89 
 
 		 438 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0129  FAD dependent oxidoreductase  36.96 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2369  FAD dependent oxidoreductase  37.96 
 
 		 424 aa  253  6e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2198  FAD dependent oxidoreductase  38.81 
 
 		 446 aa  251  3e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3598  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.96 
 
 		 438 aa  248  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0590  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.95 
 
 		 407 aa  231  3e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00186747  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00140  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.69 
 
 		 388 aa  208  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0333  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 		 401 aa  198  2.0000000000000003e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.882916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2615  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 		 553 aa  152  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.489125  normal  0.819562 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0484  monooxygenase FAD-binding protein  32.98 
 
 		 561 aa  151  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35565  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3065  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  30.77 
 
 		 571 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1988  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  29.35 
 
 		 545 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.964915  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  28.82 
 
 		 395 aa  137  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>