More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0083 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  98.6 
 
 		 428 aa  857    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00047  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  89.02 
 
 		 428 aa  772    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  89.02 
 
 		 428 aa  772    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  89.02 
 
 		 428 aa  772    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3612  putative oxidoreductase FixC  89.02 
 
 		 428 aa  772    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  99.53 
 
 		 428 aa  866    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  100 
 
 		 428 aa  870    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0047  putative oxidoreductase FixC  88.79 
 
 		 428 aa  772    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  99.07 
 
 		 428 aa  864    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  99.53 
 
 		 428 aa  866    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  89.02 
 
 		 428 aa  772    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0045  putative oxidoreductase FixC  88.79 
 
 		 428 aa  768    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820288  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  88.79 
 
 		 428 aa  770    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3232  FAD dependent oxidoreductase  63.49 
 
 		 430 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2679  FAD dependent oxidoreductase  63.26 
 
 		 430 aa  559  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4041  FAD dependent oxidoreductase  61.77 
 
 		 429 aa  556  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01668  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  60.84 
 
 		 429 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01657  hypothetical protein  60.84 
 
 		 429 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1496  hypothetical protein  60.84 
 
 		 429 aa  535  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.403861 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2416  hypothetical protein  60.61 
 
 		 429 aa  535  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1943  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.61 
 
 		 429 aa  533  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633206  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1916  hypothetical protein  60.14 
 
 		 429 aa  534  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1932  hypothetical protein  60.14 
 
 		 429 aa  530  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1902  hypothetical protein  59.67 
 
 		 429 aa  529  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1397  hypothetical protein  60.37 
 
 		 429 aa  528  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222986  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1464  hypothetical protein  60.84 
 
 		 428 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.682941  normal  0.67626 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1992  hypothetical protein  60.84 
 
 		 428 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.594962  normal  0.0242177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1448  hypothetical protein  60.84 
 
 		 428 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1820  hypothetical protein  60.84 
 
 		 428 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1482  hypothetical protein  60.84 
 
 		 428 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839158  normal  0.0909638 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  57.51 
 
 		 429 aa  508  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  55.35 
 
 		 430 aa  496  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.33 
 
 		 430 aa  478  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3927  FAD dependent oxidoreductase  48.95 
 
 		 431 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1843  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  50.81 
 
 		 431 aa  402  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.186881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09250  flavin-dependent dehydrogenase  48.24 
 
 		 442 aa  390  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.696714 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3106  FAD dependent oxidoreductase  46.31 
 
 		 472 aa  382  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000790545 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1822  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  46.85 
 
 		 431 aa  383  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.170222 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27800  flavin-dependent dehydrogenase  45.92 
 
 		 439 aa  361  2e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  43.52 
 
 		 432 aa  358  9e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2124  hypothetical protein  48.59 
 
 		 428 aa  351  1e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08770  flavin-dependent dehydrogenase  45.09 
 
 		 437 aa  344  1e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.9458 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2906  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  42.46 
 
 		 423 aa  332  6e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3068  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  42 
 
 		 423 aa  330  3e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4021  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  42 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2895  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  41.76 
 
 		 423 aa  326  5e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02611  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  41.53 
 
 		 423 aa  325  7e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0922  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  41.53 
 
 		 423 aa  325  7e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.713397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02574  hypothetical protein  41.53 
 
 		 423 aa  325  7e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0946  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  41.53 
 
 		 423 aa  325  9e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1434  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  42.38 
 
 		 442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3107  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  41.53 
 
 		 422 aa  320  3e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.916046  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0479  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.42 
 
 		 425 aa  309  5e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000230935  decreased coverage  0.000263259 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  42.82 
 
 		 434 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1370  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  40.59 
 
 		 434 aa  302  6.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2265  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  40.05 
 
 		 433 aa  298  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00453186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  40.56 
 
 		 432 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2315  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  39.66 
 
 		 436 aa  292  6e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0377746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0060  FAD dependent oxidoreductase  42.16 
 
 		 432 aa  292  8e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012744 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1434  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  39.86 
 
 		 436 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000988984  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1194  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  42.82 
 
 		 432 aa  290  4e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0537689 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1478  fixC protein  42.82 
 
 		 432 aa  290  4e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0489  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.98 
 
 		 433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.905872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3575  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.35 
 
 		 435 aa  281  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120471  normal  0.145615 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10540  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase, FixC  42.28 
 
 		 432 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106956  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7737  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  39.33 
 
 		 436 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0140  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.89 
 
 		 435 aa  278  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.942085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5870  FixC protein  38.31 
 
 		 435 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100427  normal  0.798669 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.19 
 
 		 430 aa  272  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1553  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.57 
 
 		 436 aa  268  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.229666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5084  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.07 
 
 		 435 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3614  FAD dependent oxidoreductase  36.43 
 
 		 435 aa  266  4e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119671 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0986  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.96 
 
 		 435 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.105953 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1540  FAD dependent oxidoreductase  39.71 
 
 		 431 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0129  FAD dependent oxidoreductase  37.41 
 
 		 436 aa  258  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1090  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.23 
 
 		 435 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4013  FAD dependent oxidoreductase  37.77 
 
 		 435 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0648  FAD dependent oxidoreductase  38.28 
 
 		 424 aa  257  3e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.567553  hitchhiker  0.0038978 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0958  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.8 
 
 		 437 aa  255  9e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2135  FAD dependent oxidoreductase  40.36 
 
 		 424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6230  FAD dependent oxidoreductase  36.83 
 
 		 435 aa  253  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4446  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.51 
 
 		 435 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4927  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.37 
 
 		 435 aa  249  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2369  FAD dependent oxidoreductase  41.95 
 
 		 424 aa  246  4e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3860  FAD dependent oxidoreductase  36.88 
 
 		 438 aa  244  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00230775  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1195  FAD dependent oxidoreductase  35.11 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  35.11 
 
 		 438 aa  243  6e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5046  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  34.16 
 
 		 435 aa  242  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2000  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.22 
 
 		 426 aa  237  3e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1937  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  37.19 
 
 		 431 aa  236  6e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3598  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.93 
 
 		 438 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2198  FAD dependent oxidoreductase  39.65 
 
 		 446 aa  231  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0590  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.5 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00186747  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00140  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.57 
 
 		 388 aa  197  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0333  FAD dependent oxidoreductase  34.85 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.882916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2615  FAD dependent oxidoreductase  35.98 
 
 		 553 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.489125  normal  0.819562 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0484  monooxygenase FAD-binding protein  34.76 
 
 		 561 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35565  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3065  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.87 
 
 		 571 aa  150  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  31.83 
 
 		 395 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2059  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  30.08 
 
 		 558 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>