More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0636 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  100 
 
 
395 aa  796    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1249  FAD dependent oxidoreductase  55.98 
 
 
387 aa  399  9.999999999999999e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  36.24 
 
 
438 aa  182  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2265  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  35.35 
 
 
433 aa  180  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00453186  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  35.38 
 
 
434 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1195  FAD dependent oxidoreductase  35.67 
 
 
438 aa  176  7e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0958  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.77 
 
 
437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0479  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  32.64 
 
 
425 aa  172  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000230935  decreased coverage  0.000263259 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1434  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.33 
 
 
436 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000988984  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7737  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  32.32 
 
 
436 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393449  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0489  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.35 
 
 
433 aa  168  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.905872  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  30.36 
 
 
432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10540  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase, FixC  33.63 
 
 
432 aa  166  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106956  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1553  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  31.1 
 
 
436 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.229666 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5046  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  34.56 
 
 
435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113413  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2315  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  31.61 
 
 
436 aa  164  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0377746  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3575  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  31.85 
 
 
435 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120471  normal  0.145615 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1370  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  32.54 
 
 
434 aa  161  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0986  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.54 
 
 
435 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.105953 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  33.43 
 
 
432 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.62 
 
 
430 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4927  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.05 
 
 
435 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3614  FAD dependent oxidoreductase  33.84 
 
 
435 aa  157  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119671 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3598  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.78 
 
 
438 aa  156  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5084  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.05 
 
 
435 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01668  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  30.57 
 
 
429 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0590  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.77 
 
 
407 aa  155  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00186747  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2416  hypothetical protein  30.31 
 
 
429 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01657  hypothetical protein  30.57 
 
 
429 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1496  hypothetical protein  30.31 
 
 
429 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403861 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1943  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  30.31 
 
 
429 aa  154  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633206  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1194  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.05 
 
 
432 aa  153  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0537689 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1478  fixC protein  35.05 
 
 
432 aa  153  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1916  hypothetical protein  30.31 
 
 
429 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1090  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.84 
 
 
435 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1932  hypothetical protein  30.05 
 
 
429 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5870  FixC protein  34.52 
 
 
435 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100427  normal  0.798669 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1902  hypothetical protein  30.05 
 
 
429 aa  150  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4446  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  34.04 
 
 
435 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6230  FAD dependent oxidoreductase  34.76 
 
 
435 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  32.39 
 
 
428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  32.11 
 
 
428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  31.83 
 
 
428 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  29.24 
 
 
430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  31.83 
 
 
428 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0140  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.84 
 
 
435 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.942085 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3927  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 
431 aa  146  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  31.55 
 
 
428 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0060  FAD dependent oxidoreductase  33.14 
 
 
432 aa  143  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4013  FAD dependent oxidoreductase  32.73 
 
 
435 aa  143  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2124  hypothetical protein  33.72 
 
 
428 aa  142  9e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  31.45 
 
 
430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0047  putative oxidoreductase FixC  32.69 
 
 
428 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2369  FAD dependent oxidoreductase  35.63 
 
 
424 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  31.83 
 
 
428 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00047  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  31.83 
 
 
428 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 
428 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  31.83 
 
 
428 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3612  putative oxidoreductase FixC  31.83 
 
 
428 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  31.83 
 
 
428 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3860  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 
438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00230775  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3232  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 
430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1992  hypothetical protein  32.34 
 
 
428 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.594962  normal  0.0242177 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1820  hypothetical protein  32.34 
 
 
428 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0045  putative oxidoreductase FixC  31.55 
 
 
428 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820288  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1448  hypothetical protein  32.34 
 
 
428 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1464  hypothetical protein  32.34 
 
 
428 aa  136  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.682941  normal  0.67626 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1482  hypothetical protein  32.34 
 
 
428 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839158  normal  0.0909638 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2679  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 
430 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1397  hypothetical protein  31.83 
 
 
429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222986  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0648  FAD dependent oxidoreductase  33.63 
 
 
424 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.567553  hitchhiker  0.0038978 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
429 aa  133  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4041  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 
429 aa  133  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2198  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 
446 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09250  flavin-dependent dehydrogenase  31.05 
 
 
442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.696714 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3106  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 
472 aa  130  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000790545 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1822  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  30.29 
 
 
431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.170222 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2135  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 
424 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2000  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.25 
 
 
426 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0333  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 
401 aa  120  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.882916  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1434  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  26.96 
 
 
442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1540  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 
431 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1937  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  30.17 
 
 
431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0129  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 
436 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1843  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  31.75 
 
 
431 aa  109  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.186881  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27800  flavin-dependent dehydrogenase  30.09 
 
 
439 aa  109  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2895  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.43 
 
 
423 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4021  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.43 
 
 
423 aa  104  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2906  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.43 
 
 
423 aa  103  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3068  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.43 
 
 
423 aa  103  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02611  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  29.43 
 
 
423 aa  103  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0922  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  29.43 
 
 
423 aa  103  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.713397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02574  hypothetical protein  29.43 
 
 
423 aa  103  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0946  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  29.43 
 
 
423 aa  103  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3107  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.43 
 
 
422 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.916046  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08770  flavin-dependent dehydrogenase  30.31 
 
 
437 aa  101  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.9458 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  29.49 
 
 
390 aa  95.9  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  29.78 
 
 
390 aa  94.4  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  28.93 
 
 
390 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2615  FAD dependent oxidoreductase  28.89 
 
 
553 aa  91.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.489125  normal  0.819562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>