More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3598 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0958  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  94.5 
 
 
437 aa  815    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3598  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  100 
 
 
438 aa  889    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1370  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  46.31 
 
 
434 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  42.63 
 
 
438 aa  386  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1195  FAD dependent oxidoreductase  42.4 
 
 
438 aa  382  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  45.71 
 
 
430 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2265  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  44.21 
 
 
433 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00453186  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1434  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  44.93 
 
 
436 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000988984  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7737  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  44.93 
 
 
436 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393449  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0060  FAD dependent oxidoreductase  48.84 
 
 
432 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012744 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2315  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  43.55 
 
 
436 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0377746  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1553  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  46.08 
 
 
436 aa  365  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.229666 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1937  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  44.55 
 
 
431 aa  363  2e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1540  FAD dependent oxidoreductase  44.32 
 
 
431 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0140  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  44.47 
 
 
435 aa  354  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.942085 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0489  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  42.73 
 
 
433 aa  353  4e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.905872  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1478  fixC protein  44.91 
 
 
432 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1194  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  44.91 
 
 
432 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0537689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5870  FixC protein  44.01 
 
 
435 aa  348  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100427  normal  0.798669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3575  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  43.68 
 
 
435 aa  345  8e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120471  normal  0.145615 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5084  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  44.93 
 
 
435 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0986  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  43.88 
 
 
435 aa  342  7e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.105953 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4446  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  44.01 
 
 
435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10540  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase, FixC  44.68 
 
 
432 aa  336  3.9999999999999995e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106956  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1090  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  44.01 
 
 
435 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3614  FAD dependent oxidoreductase  42.73 
 
 
435 aa  331  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4013  FAD dependent oxidoreductase  42.76 
 
 
435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5046  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  39.72 
 
 
435 aa  319  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113413  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4927  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  39.86 
 
 
435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6230  FAD dependent oxidoreductase  40.78 
 
 
435 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.58 
 
 
432 aa  298  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  38.8 
 
 
432 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  40 
 
 
434 aa  280  5e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3106  FAD dependent oxidoreductase  37.53 
 
 
472 aa  276  7e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000790545 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3232  FAD dependent oxidoreductase  36.96 
 
 
430 aa  273  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1822  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  37.12 
 
 
431 aa  273  6e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.170222 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09250  flavin-dependent dehydrogenase  39.19 
 
 
442 aa  270  4e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.696714 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  36.96 
 
 
430 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3927  FAD dependent oxidoreductase  39.42 
 
 
431 aa  266  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1397  hypothetical protein  39.85 
 
 
429 aa  266  5e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222986  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  39.16 
 
 
428 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  38.93 
 
 
428 aa  266  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0129  FAD dependent oxidoreductase  40.1 
 
 
436 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  38.93 
 
 
428 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  38.93 
 
 
428 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4041  FAD dependent oxidoreductase  37.11 
 
 
429 aa  263  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  38.93 
 
 
428 aa  263  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.65 
 
 
430 aa  260  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1434  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  37.3 
 
 
442 aa  259  7e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0047  putative oxidoreductase FixC  40.24 
 
 
428 aa  259  8e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2416  hypothetical protein  39.17 
 
 
429 aa  257  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00047  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  40 
 
 
428 aa  257  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 
428 aa  257  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  40 
 
 
428 aa  257  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  40 
 
 
428 aa  257  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3612  putative oxidoreductase FixC  40 
 
 
428 aa  257  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  36.74 
 
 
429 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1943  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  39.17 
 
 
429 aa  256  6e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633206  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01668  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  39.17 
 
 
429 aa  255  9e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  40 
 
 
428 aa  255  9e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01657  hypothetical protein  39.17 
 
 
429 aa  255  9e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1916  hypothetical protein  38.93 
 
 
429 aa  255  9e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1843  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  39.03 
 
 
431 aa  255  1.0000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.186881  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1496  hypothetical protein  38.93 
 
 
429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403861 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2679  FAD dependent oxidoreductase  36.71 
 
 
430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0045  putative oxidoreductase FixC  39.51 
 
 
428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820288  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1932  hypothetical protein  38.69 
 
 
429 aa  253  6e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1902  hypothetical protein  38.69 
 
 
429 aa  253  6e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0479  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.52 
 
 
425 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000230935  decreased coverage  0.000263259 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2198  FAD dependent oxidoreductase  41.48 
 
 
446 aa  243  6e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08770  flavin-dependent dehydrogenase  35.99 
 
 
437 aa  242  7.999999999999999e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.9458 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1482  hypothetical protein  38.07 
 
 
428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839158  normal  0.0909638 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1992  hypothetical protein  37.83 
 
 
428 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.594962  normal  0.0242177 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1820  hypothetical protein  37.83 
 
 
428 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1464  hypothetical protein  37.83 
 
 
428 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.682941  normal  0.67626 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2124  hypothetical protein  36.68 
 
 
428 aa  231  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27800  flavin-dependent dehydrogenase  33.96 
 
 
439 aa  229  6e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1448  hypothetical protein  37.83 
 
 
428 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00140  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.95 
 
 
388 aa  216  9e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3860  FAD dependent oxidoreductase  36.72 
 
 
438 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00230775  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4021  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.22 
 
 
423 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2906  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.98 
 
 
423 aa  203  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02611  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  31.98 
 
 
423 aa  202  7e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0922  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  31.98 
 
 
423 aa  202  7e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.713397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02574  hypothetical protein  31.98 
 
 
423 aa  202  7e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3068  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.74 
 
 
423 aa  202  7e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0946  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  31.98 
 
 
423 aa  202  8e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2135  FAD dependent oxidoreductase  36.53 
 
 
424 aa  200  5e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2369  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 
424 aa  199  9e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0590  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.41 
 
 
407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00186747  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3107  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.98 
 
 
422 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.916046  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2895  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.26 
 
 
423 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2000  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  37.25 
 
 
426 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0648  FAD dependent oxidoreductase  36.41 
 
 
424 aa  195  2e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.567553  hitchhiker  0.0038978 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  35.78 
 
 
395 aa  192  8e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0333  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 
401 aa  160  3e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.882916  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1249  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 
387 aa  151  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1800  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  30.66 
 
 
545 aa  151  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2615  FAD dependent oxidoreductase  34.22 
 
 
553 aa  150  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.489125  normal  0.819562 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16430  Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  28.01 
 
 
549 aa  149  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0960517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>