More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1937 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1937  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  100 
 
 
431 aa  884    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1540  FAD dependent oxidoreductase  77.96 
 
 
431 aa  690    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1370  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  48.85 
 
 
434 aa  439  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0060  FAD dependent oxidoreductase  51.74 
 
 
432 aa  434  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012744 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  48.02 
 
 
430 aa  426  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2315  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  46.19 
 
 
436 aa  421  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0377746  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1478  fixC protein  48.61 
 
 
432 aa  415  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1194  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  48.61 
 
 
432 aa  415  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0537689 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1434  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  46.65 
 
 
436 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000988984  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7737  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  46.17 
 
 
436 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393449  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10540  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase, FixC  47.69 
 
 
432 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106956  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2265  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  46.64 
 
 
433 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00453186  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0140  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  47.92 
 
 
435 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.942085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5870  FixC protein  48.37 
 
 
435 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100427  normal  0.798669 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3614  FAD dependent oxidoreductase  48.14 
 
 
435 aa  381  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119671 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0489  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  44.7 
 
 
433 aa  376  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.905872  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0958  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  44.08 
 
 
437 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1195  FAD dependent oxidoreductase  43.86 
 
 
438 aa  372  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  43.86 
 
 
438 aa  372  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3575  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  46.74 
 
 
435 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120471  normal  0.145615 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5084  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  47.21 
 
 
435 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3598  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  44.55 
 
 
438 aa  366  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1553  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  44.65 
 
 
436 aa  364  2e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.229666 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4446  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  46.06 
 
 
435 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0986  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  45.35 
 
 
435 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.105953 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1090  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  46.28 
 
 
435 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4927  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  45.12 
 
 
435 aa  352  8e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4013  FAD dependent oxidoreductase  45.14 
 
 
435 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6230  FAD dependent oxidoreductase  45.14 
 
 
435 aa  346  4e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5046  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  43.49 
 
 
435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113413  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  41.3 
 
 
430 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  42.75 
 
 
432 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  41.67 
 
 
430 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  42.92 
 
 
429 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  43.18 
 
 
434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3927  FAD dependent oxidoreductase  38.52 
 
 
431 aa  299  6e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0479  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  39.39 
 
 
425 aa  293  5e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000230935  decreased coverage  0.000263259 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  37.1 
 
 
432 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3232  FAD dependent oxidoreductase  39.27 
 
 
430 aa  287  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3106  FAD dependent oxidoreductase  36.87 
 
 
472 aa  285  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000790545 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0129  FAD dependent oxidoreductase  37.08 
 
 
436 aa  283  5.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4041  FAD dependent oxidoreductase  38.88 
 
 
429 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1822  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  36.78 
 
 
431 aa  281  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.170222 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2679  FAD dependent oxidoreductase  38.5 
 
 
430 aa  280  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1397  hypothetical protein  38.59 
 
 
429 aa  280  4e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222986  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  37.71 
 
 
428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1843  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  38.52 
 
 
431 aa  273  3e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.186881  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1434  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  35.96 
 
 
442 aa  273  6e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2124  hypothetical protein  38.37 
 
 
428 aa  270  4e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1496  hypothetical protein  37.88 
 
 
429 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403861 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  37.23 
 
 
428 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  37.86 
 
 
428 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  37.86 
 
 
428 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  37.86 
 
 
428 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2416  hypothetical protein  37.18 
 
 
429 aa  264  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1916  hypothetical protein  37.41 
 
 
429 aa  263  6e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1943  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  37.41 
 
 
429 aa  262  8e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633206  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01668  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  37.18 
 
 
429 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01657  hypothetical protein  37.18 
 
 
429 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1932  hypothetical protein  37.18 
 
 
429 aa  260  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1902  hypothetical protein  37.26 
 
 
429 aa  259  7e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  36.52 
 
 
428 aa  259  9e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00047  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  36.52 
 
 
428 aa  259  9e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  36.52 
 
 
428 aa  259  9e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0047  putative oxidoreductase FixC  36.52 
 
 
428 aa  259  9e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3612  putative oxidoreductase FixC  36.52 
 
 
428 aa  259  9e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  36.52 
 
 
428 aa  259  9e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0045  putative oxidoreductase FixC  36.52 
 
 
428 aa  258  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820288  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  36.52 
 
 
428 aa  258  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00140  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.57 
 
 
388 aa  251  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2198  FAD dependent oxidoreductase  39.32 
 
 
446 aa  247  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27800  flavin-dependent dehydrogenase  35.28 
 
 
439 aa  247  4e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1482  hypothetical protein  36.24 
 
 
428 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839158  normal  0.0909638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1820  hypothetical protein  36 
 
 
428 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1992  hypothetical protein  36 
 
 
428 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.594962  normal  0.0242177 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1464  hypothetical protein  36 
 
 
428 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.682941  normal  0.67626 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09250  flavin-dependent dehydrogenase  35.16 
 
 
442 aa  241  2e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.696714 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1448  hypothetical protein  35.9 
 
 
428 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08770  flavin-dependent dehydrogenase  34.02 
 
 
437 aa  239  6.999999999999999e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.9458 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3860  FAD dependent oxidoreductase  34.16 
 
 
438 aa  218  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00230775  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0648  FAD dependent oxidoreductase  36.04 
 
 
424 aa  208  2e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.567553  hitchhiker  0.0038978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02611  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  33.01 
 
 
423 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0922  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.01 
 
 
423 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.713397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02574  hypothetical protein  33.01 
 
 
423 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0946  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  32.77 
 
 
423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3068  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.77 
 
 
423 aa  199  6e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2369  FAD dependent oxidoreductase  36.25 
 
 
424 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2906  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.53 
 
 
423 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4021  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.53 
 
 
423 aa  196  9e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2135  FAD dependent oxidoreductase  35.52 
 
 
424 aa  194  3e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2895  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.05 
 
 
423 aa  193  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3107  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  33.01 
 
 
422 aa  193  6e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.916046  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2000  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.52 
 
 
426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0590  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.02 
 
 
407 aa  182  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00186747  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0333  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 
401 aa  167  4e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.882916  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  30.17 
 
 
395 aa  139  7.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0424  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  32.84 
 
 
551 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.349819  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1777  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase precursor  32.84 
 
 
551 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.964971  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3065  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  26 
 
 
571 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00995  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  29.15 
 
 
544 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00336804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>