282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1650 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1650  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 381 aa  767    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0709  geranylgeranyl reductase  80.91 
 
 		 377 aa  605  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07601  NAD binding site  69.79 
 
 		 375 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05221  NAD binding site  61.76 
 
 		 375 aa  481  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  56.27 
 
 		 376 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  56.27 
 
 		 376 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  46.9 
 
 		 377 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  46.49 
 
 		 377 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  48.37 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0520  NAD binding site  46.49 
 
 		 377 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  44.14 
 
 		 376 aa  286  5e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  38.86 
 
 		 373 aa  270  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  37.5 
 
 		 373 aa  268  8.999999999999999e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  37.87 
 
 		 374 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  36.51 
 
 		 368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  36.04 
 
 		 370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  34.86 
 
 		 376 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  30.57 
 
 		 378 aa  126  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  29.41 
 
 		 375 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  26.28 
 
 		 362 aa  105  9e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  27.45 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  29.73 
 
 		 413 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  28.07 
 
 		 382 aa  93.6  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  27.68 
 
 		 403 aa  93.6  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  23.33 
 
 		 387 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1604  geranylgeranyl reductase  25.83 
 
 		 391 aa  90.1  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  24.8 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  29.07 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 		 430 aa  86.7  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  26.39 
 
 		 368 aa  86.3  9e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  29.19 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  24.28 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  26.52 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  24.74 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2391  geranylgeranyl reductase  27.57 
 
 		 375 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  29.23 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  29.77 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  27.85 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  29.66 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  27.84 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  28.2 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  28.11 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  28.1 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  26.13 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  23.04 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  28.64 
 
 		 435 aa  75.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  28.4 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  23.56 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  30.06 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  28.27 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  24.23 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  29.05 
 
 		 431 aa  74.7  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  26.71 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  28.38 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1464  hypothetical protein  29.18 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.682941  normal  0.67626 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  27.11 
 
 		 384 aa  72.8  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1482  hypothetical protein  29.18 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839158  normal  0.0909638 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  25.23 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  27.08 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  23.94 
 
 		 390 aa  72  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1448  hypothetical protein  29.18 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1992  hypothetical protein  28.85 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.594962  normal  0.0242177 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1820  hypothetical protein  28.85 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  28.46 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  24 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  26.35 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  26.65 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  27.86 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1932  hypothetical protein  28.98 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3232  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  24.94 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1916  hypothetical protein  29.3 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  22.52 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  24.4 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  27 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  27.01 
 
 		 457 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  32.01 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  26.71 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  26.71 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  24.94 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  24.56 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  23.93 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4041  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2416  hypothetical protein  29.35 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1943  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.66 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633206  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  25.41 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.66 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  29.39 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1902  hypothetical protein  28.98 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1496  hypothetical protein  28.66 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.403861 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 429 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  29.01 
 
 		 445 aa  67  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01668  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  28.66 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01657  hypothetical protein  28.66 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.75 
 
 		 449 aa  66.6  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25.15 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>