54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_43800 on replicon NC_009374
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009374  OSTLU_43800  predicted protein  100 
 
 		 528 aa  1085    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43511  predicted protein  35.31 
 
 		 442 aa  257  3e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.746424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2062  lycopene cyclase (CrtL-type)  32.3 
 
 		 411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2643  lycopene cyclase family protein  34.36 
 
 		 413 aa  230  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56484  precursor of cyclase lycopene beta cyclase  32.55 
 
 		 659 aa  226  6e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00169655  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2711  lycopene cyclase family protein  33.25 
 
 		 413 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06991  putative lycopene epsilon cyclase  30.4 
 
 		 427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.28746  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0633  lycopene cyclase (CrtL-type)  30.5 
 
 		 427 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09161  putative lycopene beta cyclase  31.25 
 
 		 408 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15221  putative lycopene beta cyclase  29.45 
 
 		 414 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0688  lycopene cyclase (CrtL-type)  28.98 
 
 		 414 aa  194  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.103999  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06891  putative lycopene epsilon cyclase  30.15 
 
 		 422 aa  192  9e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.895812  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06601  putative lycopene epsilon cyclase  30.15 
 
 		 427 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1941  lycopene cyclase (CrtL-type)  30.37 
 
 		 412 aa  191  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0724  lycopene cyclase, beta and epsilon  31.79 
 
 		 407 aa  189  8e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11541  putative lycopene beta cyclase  30 
 
 		 403 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0749733  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11261  putative lycopene beta cyclase  31.96 
 
 		 407 aa  180  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06951  putative lycopene epsilon cyclase  29.9 
 
 		 428 aa  179  8e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0073  lycopene cyclase (CrtL-type)  30.25 
 
 		 428 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11691  putative lycopene beta cyclase  29.97 
 
 		 403 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.451912  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11701  putative lycopene beta cyclase  30.23 
 
 		 403 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07411  putative lycopene epsilon cyclase  30.5 
 
 		 427 aa  173  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0418129  normal  0.37911 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1075  lycopene cyclase (CrtL-type)  29.72 
 
 		 403 aa  171  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23511  putative lycopene epsilon cyclase  30.23 
 
 		 426 aa  166  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0950  lycopene cyclase family protein  31.25 
 
 		 401 aa  166  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.75613 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0857  lycopene cyclase, beta and epsilon  30.92 
 
 		 435 aa  159  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.27031 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5914  lycopene cyclase family protein  30.99 
 
 		 399 aa  158  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2394  lycopene cyclase family protein  26.67 
 
 		 374 aa  117  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.990938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5144  lycopene cyclase family protein  28.85 
 
 		 359 aa  93.6  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2495  Lycopene beta and epsilon cyclase  26.65 
 
 		 351 aa  79.7  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  31.41 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  30.92 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2038  lycopene beta and epsilon cyclase  22.9 
 
 		 417 aa  54.7  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0447  Lycopene beta and epsilon cyclase  25.59 
 
 		 393 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0431  hypothetical protein  28.65 
 
 		 422 aa  52.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.446535  normal  0.169558 
 
 
-
 
NC_002950  PG0802  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  33.9 
 
 		 449 aa  49.7  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  23.53 
 
 		 379 aa  49.3  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1563  Lycopene beta and epsilon cyclase  25.08 
 
 		 391 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  26.51 
 
 		 390 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  24.24 
 
 		 390 aa  47.4  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1817  lycopene cyclase  25.57 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6387  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.95 
 
 		 565 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.0107564 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3576  lycopene cyclase  26.11 
 
 		 385 aa  45.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.243504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1057  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase domain protein  37.84 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 410 aa  45.8  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  25.75 
 
 		 317 aa  44.7  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3088  putative lycopene cyclase  25.32 
 
 		 393 aa  44.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0206  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  52.27 
 
 		 488 aa  44.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324134  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3135  lycopene cyclase  27.32 
 
 		 385 aa  44.3  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.04 
 
 		 469 aa  43.9  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0091  Lycopene beta and epsilon cyclase  25.49 
 
 		 382 aa  43.5  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.457408  normal  0.139356 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3693  Thioredoxin-disulfide reductase  55.56 
 
 		 564 aa  43.5  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  22.32 
 
 		 382 aa  43.5  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>