30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0633 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0633  lycopene cyclase (CrtL-type)  100 
 
 		 427 aa  887    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06601  putative lycopene epsilon cyclase  95.32 
 
 		 427 aa  856    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06891  putative lycopene epsilon cyclase  95.97 
 
 		 422 aa  852    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.895812  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06991  putative lycopene epsilon cyclase  90.16 
 
 		 427 aa  813    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.28746  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06951  putative lycopene epsilon cyclase  60.09 
 
 		 428 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0073  lycopene cyclase (CrtL-type)  60.09 
 
 		 428 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07411  putative lycopene epsilon cyclase  60.19 
 
 		 427 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0418129  normal  0.37911 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23511  putative lycopene epsilon cyclase  60.43 
 
 		 426 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1941  lycopene cyclase (CrtL-type)  48.88 
 
 		 412 aa  428  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2062  lycopene cyclase (CrtL-type)  49.4 
 
 		 411 aa  430  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0688  lycopene cyclase (CrtL-type)  48.56 
 
 		 414 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.103999  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15221  putative lycopene beta cyclase  48.56 
 
 		 414 aa  408  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09161  putative lycopene beta cyclase  47.39 
 
 		 408 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11261  putative lycopene beta cyclase  50.37 
 
 		 407 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2643  lycopene cyclase family protein  45.08 
 
 		 413 aa  396  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0724  lycopene cyclase, beta and epsilon  49.5 
 
 		 407 aa  394  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11541  putative lycopene beta cyclase  47.51 
 
 		 403 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0749733  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11691  putative lycopene beta cyclase  48.15 
 
 		 403 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.451912  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11701  putative lycopene beta cyclase  47.9 
 
 		 403 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1075  lycopene cyclase (CrtL-type)  47.9 
 
 		 403 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2711  lycopene cyclase family protein  42.86 
 
 		 413 aa  361  1e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43511  predicted protein  33.1 
 
 		 442 aa  209  6e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.746424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43800  predicted protein  30.5 
 
 		 528 aa  196  8.000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0950  lycopene cyclase family protein  31.73 
 
 		 401 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.75613 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0857  lycopene cyclase, beta and epsilon  30.73 
 
 		 435 aa  172  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.27031 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56484  precursor of cyclase lycopene beta cyclase  31.19 
 
 		 659 aa  169  7e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00169655  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5914  lycopene cyclase family protein  29.66 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2394  lycopene cyclase family protein  27.11 
 
 		 374 aa  130  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.990938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5144  lycopene cyclase family protein  28.01 
 
 		 359 aa  116  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2495  Lycopene beta and epsilon cyclase  24.92 
 
 		 351 aa  62  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>