41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0950 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0950  lycopene cyclase family protein  100 
 
 		 401 aa  780    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.75613 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5914  lycopene cyclase family protein  72.01 
 
 		 399 aa  530  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5144  lycopene cyclase family protein  47.75 
 
 		 359 aa  220  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2062  lycopene cyclase (CrtL-type)  34.17 
 
 		 411 aa  196  7e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2711  lycopene cyclase family protein  38.86 
 
 		 413 aa  190  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2643  lycopene cyclase family protein  36.25 
 
 		 413 aa  187  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2394  lycopene cyclase family protein  37.37 
 
 		 374 aa  184  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.990938  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09161  putative lycopene beta cyclase  34.51 
 
 		 408 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0633  lycopene cyclase (CrtL-type)  32.23 
 
 		 427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06891  putative lycopene epsilon cyclase  31.73 
 
 		 422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.895812  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06601  putative lycopene epsilon cyclase  31.73 
 
 		 427 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43800  predicted protein  31.66 
 
 		 528 aa  170  4e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06991  putative lycopene epsilon cyclase  31.98 
 
 		 427 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.28746  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06951  putative lycopene epsilon cyclase  32.16 
 
 		 428 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0688  lycopene cyclase (CrtL-type)  30.17 
 
 		 414 aa  169  9e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.103999  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11691  putative lycopene beta cyclase  27.92 
 
 		 403 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.451912  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15221  putative lycopene beta cyclase  30.17 
 
 		 414 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0073  lycopene cyclase (CrtL-type)  31.41 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11261  putative lycopene beta cyclase  32.99 
 
 		 407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11701  putative lycopene beta cyclase  28.17 
 
 		 403 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23511  putative lycopene epsilon cyclase  35.12 
 
 		 426 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1941  lycopene cyclase (CrtL-type)  33.58 
 
 		 412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1075  lycopene cyclase (CrtL-type)  28.17 
 
 		 403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07411  putative lycopene epsilon cyclase  32.45 
 
 		 427 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0418129  normal  0.37911 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11541  putative lycopene beta cyclase  29.07 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0749733  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0857  lycopene cyclase, beta and epsilon  39.95 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.27031 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0724  lycopene cyclase, beta and epsilon  32.92 
 
 		 407 aa  150  4e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43511  predicted protein  31.03 
 
 		 442 aa  138  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.746424  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2495  Lycopene beta and epsilon cyclase  37.01 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56484  precursor of cyclase lycopene beta cyclase  27.67 
 
 		 659 aa  115  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00169655  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2038  lycopene beta and epsilon cyclase  27.06 
 
 		 417 aa  53.5  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1223  hypothetical protein  30.29 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417848  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  40.74 
 
 		 546 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3576  lycopene cyclase  29.44 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.243504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1702  PimS2 protein  33.33 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.665919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2948  monooxygenase FAD-binding  29.09 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284077  normal  0.479686 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  26.5 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0012  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.51 
 
 		 566 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.492266  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1817  lycopene cyclase  26.39 
 
 		 398 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3940  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  32.35 
 
 		 627 aa  43.5  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  23.57 
 
 		 414 aa  43.1  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>