35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0857 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0857  lycopene cyclase, beta and epsilon  100 
 
 		 435 aa  844    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.27031 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2711  lycopene cyclase family protein  44.78 
 
 		 413 aa  276  7e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2643  lycopene cyclase family protein  42.93 
 
 		 413 aa  271  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2062  lycopene cyclase (CrtL-type)  39.29 
 
 		 411 aa  245  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09161  putative lycopene beta cyclase  41.24 
 
 		 408 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06951  putative lycopene epsilon cyclase  34.49 
 
 		 428 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0073  lycopene cyclase (CrtL-type)  33.25 
 
 		 428 aa  212  9e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11541  putative lycopene beta cyclase  33 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0749733  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0724  lycopene cyclase, beta and epsilon  39.45 
 
 		 407 aa  211  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1941  lycopene cyclase (CrtL-type)  39.26 
 
 		 412 aa  211  3e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0688  lycopene cyclase (CrtL-type)  35.07 
 
 		 414 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.103999  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15221  putative lycopene beta cyclase  35.07 
 
 		 414 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11261  putative lycopene beta cyclase  36.25 
 
 		 407 aa  206  7e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07411  putative lycopene epsilon cyclase  34.83 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0418129  normal  0.37911 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06991  putative lycopene epsilon cyclase  31.41 
 
 		 427 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.28746  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23511  putative lycopene epsilon cyclase  36.74 
 
 		 426 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11701  putative lycopene beta cyclase  32.42 
 
 		 403 aa  196  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06601  putative lycopene epsilon cyclase  31.11 
 
 		 427 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0633  lycopene cyclase (CrtL-type)  31.11 
 
 		 427 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06891  putative lycopene epsilon cyclase  30.86 
 
 		 422 aa  193  6e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.895812  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1075  lycopene cyclase (CrtL-type)  31.67 
 
 		 403 aa  193  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11691  putative lycopene beta cyclase  31.67 
 
 		 403 aa  192  9e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.451912  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0950  lycopene cyclase family protein  39.34 
 
 		 401 aa  183  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.75613 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43800  predicted protein  30.48 
 
 		 528 aa  179  8e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5914  lycopene cyclase family protein  39.56 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43511  predicted protein  31.93 
 
 		 442 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.746424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5144  lycopene cyclase family protein  40.83 
 
 		 359 aa  139  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2394  lycopene cyclase family protein  34.76 
 
 		 374 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.990938  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56484  precursor of cyclase lycopene beta cyclase  27.68 
 
 		 659 aa  127  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00169655  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2495  Lycopene beta and epsilon cyclase  34.6 
 
 		 351 aa  90.5  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2038  lycopene beta and epsilon cyclase  28.19 
 
 		 417 aa  46.6  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2209  lycopene cyclase  27.17 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  27.18 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  33.33 
 
 		 553 aa  43.1  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>