32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5914 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5914  lycopene cyclase family protein  100 
 
 		 399 aa  766    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0950  lycopene cyclase family protein  72.01 
 
 		 401 aa  526  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.75613 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5144  lycopene cyclase family protein  49.47 
 
 		 359 aa  223  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2394  lycopene cyclase family protein  40.5 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.990938  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2711  lycopene cyclase family protein  38.81 
 
 		 413 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2643  lycopene cyclase family protein  35.01 
 
 		 413 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0073  lycopene cyclase (CrtL-type)  31.2 
 
 		 428 aa  176  8e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06951  putative lycopene epsilon cyclase  31.45 
 
 		 428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0688  lycopene cyclase (CrtL-type)  31.23 
 
 		 414 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.103999  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15221  putative lycopene beta cyclase  30.83 
 
 		 414 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2062  lycopene cyclase (CrtL-type)  32.7 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11701  putative lycopene beta cyclase  28.88 
 
 		 403 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1941  lycopene cyclase (CrtL-type)  31.84 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11691  putative lycopene beta cyclase  28.53 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.451912  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09161  putative lycopene beta cyclase  35.37 
 
 		 408 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43800  predicted protein  31.22 
 
 		 528 aa  159  6e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11541  putative lycopene beta cyclase  28.87 
 
 		 403 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0749733  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06991  putative lycopene epsilon cyclase  28.92 
 
 		 427 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.28746  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1075  lycopene cyclase (CrtL-type)  29.07 
 
 		 403 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0724  lycopene cyclase, beta and epsilon  33.91 
 
 		 407 aa  158  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0857  lycopene cyclase, beta and epsilon  40.39 
 
 		 435 aa  155  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.27031 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23511  putative lycopene epsilon cyclase  34.31 
 
 		 426 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06891  putative lycopene epsilon cyclase  28.92 
 
 		 422 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.895812  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0633  lycopene cyclase (CrtL-type)  29.17 
 
 		 427 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06601  putative lycopene epsilon cyclase  28.92 
 
 		 427 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11261  putative lycopene beta cyclase  31.18 
 
 		 407 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07411  putative lycopene epsilon cyclase  29.69 
 
 		 427 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0418129  normal  0.37911 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43511  predicted protein  31.64 
 
 		 442 aa  140  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.746424  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2495  Lycopene beta and epsilon cyclase  37.79 
 
 		 351 aa  122  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56484  precursor of cyclase lycopene beta cyclase  26.72 
 
 		 659 aa  103  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00169655  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2209  lycopene cyclase  27.61 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3576  lycopene cyclase  31.45 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.243504  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>